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lixingliang

新虫 (小有名气)

[求助] ChIP难道低级到可以这样做吗？

和导师讨论课题，导师直接要求做ChIP,染色质免疫共沉淀，理由是：核蛋白就要这么研究，看看它是否是转录因子，是否和染色质结合。
导师都愿意研究当时流行的技术，但ChIP一般都研究转录因子和组蛋白修饰的，我这个蛋白目前只知道入核，其他一无所知，难道只要是核蛋白就可以做ChIP吗？？？
求指教
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我不管你看起看不起我，我都是个演员
1楼 2012-04-22 23:42:46
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-04-23 10:35:58
ChIP,染色质免疫共沉淀，是一种研究蛋白质-DNA相互作用的非常有效的方法，因为相互作用的蛋白质-DNA彼此靠近，所以可以被交联剂共价连接为一体，并被分离出来，酶解DNA后去掉蛋白质就露出了与蛋白质直接接触的DNA片段，可以对其PCR，测序等，还是相当高阶的研究技术，其高阶可能首先在于能够在研究蛋白质在细胞与DNA的直接的相互作用，虽然结果是建立在细胞挂掉之后，但毕竟细胞挂掉之前的信息还是充分表留了下来。核蛋白的具体作用位点、本身修饰变化、空间结构变化、作用对象的确定、对于基因表达调控的影响等还是有很多可以深入研究之处的。尤其是与表观遗传学联系是当今最热的研究前沿。
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2楼2012-04-23 00:31:36
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
lixingliang: 金币+3 2012-04-23 22:34:23
我们可以讨论讨论，我现在的工作片中与蛋白质，基因表达调控虽然我也很喜欢，但是有一些时间较少接触了。
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3楼2012-04-23 00:33:39
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heroyl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lixingliang: 金币+3 2012-04-23 22:34:12
个人觉得可以试一下啊，但是ChIP做起来成本也蛮高的，据说做起来也比较难做，楼主可以喝老板再商榷，多看看其它报道。
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实验虐我千百遍，我待实验如初恋
4楼2012-04-23 09:26:52
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白天没太阳

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

more false positive resulits than you think
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5楼2012-06-12 23:35:58
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bst5

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

这个实验本身成功率就不是很高，可以先在网上预测这个蛋白的结构，看是否可能是转录因子啊，然后做CAST,EMSA,Chip才有意义啊
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6楼2012-06-13 10:44:32
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lilirong2009

铜虫 (小有名气)
我的比你还糟糕，我就一小肽，老板死活要我做它与DNA的特异结合，我说没有方法，他说人家那些转录激活是怎么做的，让我借鉴。我明天就就找他说用CHIP做。
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7楼2012-07-02 17:01:33
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lilirong2009

铜虫 (小有名气)
能不能做X-晶体衍射或者核磁共振啊？
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8楼2012-07-02 17:10:40
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飞翔的麦穗

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by lilirong2009 at 2012-07-02 17:01:33
我的比你还糟糕，我就一小肽，老板死活要我做它与DNA的特异结合，我说没有方法，他说人家那些转录激活是怎么做的，让我借鉴。我明天就就找他说用CHIP做。

天下老板一样黑
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珍惜时间，珍惜生命
9楼2012-08-25 14:32:20
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tianyinghu

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

现在的硕士博士很多无能，只希望导师给个最简单好做的课题，还怪这样那样的，为什么不怪自己没好好学习呢。不是我一个本科看不起你们，你们除了学历比别人高之外，别的一无是处。来公司面试工资要的高高，条件谈的多多，一问专业知识很狭窄，真不知道现在的博士硕士怎么那么好混。
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10楼2012-08-26 20:17:44
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