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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 如何在MS里面截取特定大小、特定角度的石墨层作为吸附表面，而后建立晶胞？
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zhl98

铜虫 (小有名气)

[求助] 如何在MS里面截取特定大小、特定角度的石墨层作为吸附表面，而后建立晶胞？

由于STM的实验是采用（001）高定向裂解石墨作为基底，获得了多苯环有机分子在其上面的自组装结构。为了解释实验结果，需要对STM图像进行计算模拟。但是根据STM图像量得了二维unit cell的大小和角度，例如a、b大小分别为1.468nm、1.578nm，两者夹角为81.7度。请教各位高手，如何在MS里截取这样的大小的（001）面的石墨层作为晶胞？


本人感觉应该是涉及U、V的选择，但是操作过程中，U、V只能设置为整数；如果采用扩大晶胞的方法，但是计算机性能有限，又担心计算不了。。。。。。
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1楼 2012-04-17 14:46:32
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shmilylxc

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-04-20 08:57:51
你直接切001面不行吗，还有，你的STM是怎么做出来的啊
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2楼2012-04-17 22:55:19
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孙?�730

至尊木虫 (知名作家)

优秀版主

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-04-20 08:58:04
U、V设置为整数 是必须的了 没办法
至于究竟应该是多少 要看具体的多苯环有机分子了
起码要考虑到所有的相互作用原子位置
赞一下 回复此楼
sunyu730_emuch@126.com
3楼2012-04-20 00:31:58
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