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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 鉴定细菌种（不是属）的生物学方法有哪些
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guoliang1984

新虫 (正式写手)
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细菌做16S，真菌做18S和ITS。除此外还要结合形态特征和生理生化特征。如果16S，18S比对结果小于97%则可能是新的种，还要和标准菌株做DNA杂交，还要测脂肪酸、呼吸醌等成分。建议看看这方面的英语文章
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21楼2012-04-06 17:13:51
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feierorange

铜虫 (小有名气)
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引用回帖:
10楼: Originally posted by xinongfish at 2012-04-04 14:50:45:
这个要看你最后比对的分数是多少了，如果高于某个数值，比如99%，是可以鉴定到种的

大于99%也是不一定的，很多放线菌高于99%的相似度也被鉴定为新种，属之间的情况是不同的，细菌的话一般测个16S，想要确定的话，除了生理生化，最好再DNA-DNA杂交下！
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22楼2012-04-06 17:28:47
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gogen

金虫 (小有名气)
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上面的DNA 结果还要结合形态学和生理生化结果一起分析比较准确。。还有那个BIOLOG系统里的 鉴定板也用来检测
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23楼2012-04-06 18:05:08
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w26150665w

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by tuobaohua at 2012-04-04 08:44:01:
18S 和16S、ITS等一般都只能判断到属吧
对种的认定还需要进一步研究
可用DNA-DNA杂交吧

呵呵 嗯 我也是这样觉得
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多多交流学习
24楼2012-04-15 15:14:07
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w26150665w

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
21楼: Originally posted by guoliang1984 at 2012-04-06 17:13:51:
细菌做16S，真菌做18S和ITS。除此外还要结合形态特征和生理生化特征。如果16S，18S比对结果小于97%则可能是新的种，还要和标准菌株做DNA杂交，还要测脂肪酸、呼吸醌等成分。建议看看这方面的英语文章

好的 谢谢
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多多交流学习
25楼2012-04-15 15:14:37
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maomao890707

新虫 (初入文坛)
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生化鉴定，PCR鉴定，基因测序
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26楼2014-01-15 16:26:08
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)
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16S序列，以及一些保守的看家基因，比如dnaA基因。可以代替dna杂交的方法，细菌分类学家们推荐MLSA，有一些专门的网站，如PAMDB、PseudoMLSA database、phylosearch等。一些分子标记，比如Rep-PCR，也能作为重要证据。其它的手段，比如Biolog、质谱分析等，也常常用到。
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做一个阳光、开朗的小和尚
27楼2014-01-16 08:23:42
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cx13033236

木虫 (小有名气)
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一般16S或者18SrDNA鉴定到属这个级别是准确的，想要进一步鉴定到种就必须使用分子杂交技术了，像楼上说的DNA-DNA杂交，这才是比较严谨的分子鉴定种技术。
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28楼2014-01-16 10:05:46
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