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cactus586

金虫 (著名写手)

[交流] 历时近7个月、三轮评审后，PNAS终于接收

各位虫友：

经过200多天的折磨，三轮反复评审，咱的第一篇PNAS（生物地理学和进化领域）终于在3月23日接收发表。兴奋了五分钟之后，突然发现被折磨的时间太长了，那点快感到来时，竟然已经有些麻木了！其实一审和二审意见回来时反倒比现在更兴奋，呵呵

本文一审2011年9月1日投稿，70多天后，11月17日意见回来了。送了两个审稿人，1#审稿人positive，2#审稿人negative。可是从问题上来看的话，1#的问题具备一定的杀伤力，比如要求加算法，要求阐明一些关键化石标记节点的关键信息，有一个化石标记点不对，不过意见都是改良性质的而不是否定性质的，而且六项评定指标全部YES；2#没有找到大问题，全是碎碎念，小辫子，最后六项指标四项NO两项YES。2#审稿人最经典的评论是：NCBI accession numbers不是numbers，是alphanumeric。。。2#评审人后来我们根据审稿意见里面的细节推断出是一个领域内的老资格，这家伙分类超级棒，但是是个老顽固，不接受Molecular phylogenetics这一类新事物，认为形态学才是分类正统，无语。。。针对审稿人的意见，我们将不对的化石标记点去掉重新算计算分化时间和祖先分布区域重建分析，改了大概一个半月后在2011年的最后一天投回去了（新年前一天晚上熬了个通宵，然后元旦中午12点以前投回去的，这样美国时间还是2011年12月31日）。

二审稍微快些，2012年2月13日出的结果。这次除了前面的两个审稿人，加送了第三个审稿人。1#一如既往的nice，直接pass，提了一个很小的问题。2#接着揪小辫子，接着碎碎念，再次重申NCBI accession numbers不是numbers，是alphanumeric。。。六项指标三项飘红。。。好在出消息之前我们写信给编辑，argue这个2#审稿人可能和我们有interest conflict，因此故意拖我们的稿子。。。可以我们的信晚了一半天，所以还是算上了这个negative的意见。。。3#审稿人可能也有点酸，或者说持不同学术观点，六项指标两项飘红，但对文章的评价很高；3#执意让我们加算数据，认为在进行非严格分子中计算的时候（BEAST），化石标记的分布应该也用Lognormal算一下，而我们之前全用的是uniform；此外就是加引两篇2011年的文献，根据引文献的状况，大致也可以猜出这个审稿人是谁了。。。于是接着算数据，抓狂ing。。。幸亏两位浙大的同仁很nice，我们去德国海德堡看他们（他们在那里访问）时介绍给我一个超算网站（CIPRES），我在上面算数据可以在两天之内算掉原来两周的工作量（单线程vs八线程）！这样算数据的问题解决了之后就是将文章重新过一遍，到了2月底的时候大概改完了，就准备要投回去的时候，我问了一下并列一作要不要过一遍；他在英国爱丁堡大学，是我08年联培时的hoster。结果中枪了，在投之前又被他折磨，因为他觉得很多东西还是要告诉读者才行，现在糊弄审稿人和编辑没问题，可广大的人民群众才是最重要的，因为你的文章将来靠他们引用啊（向这种科研精神致敬）！结果折腾的筋疲力尽，连续三天睡眠时间不超过5小时，在从德国回来（之前去德国马堡访问了两个月）的前一天投回去了。可是因为前一天仅睡了2小时，所以投回去之后发现稿子里面有两个小错误。投稿那天是妇女节，日子不错呢（不过我是boy）！

三审很漫长的说，每天上PNAS网站查不下10遍（为自己hold不住惭愧

），终于在一个周六的早晨，3月23日，懒觉睡满例行公事刷状态，后来的事情大家都知道了。我喊了十来声YES，但是没有喊“Oh, GODDDDDDD~”，可能这篇稿子折腾的太久了，再加上自己一个人在家的缘故，常理之中的超级兴奋已经湮没殆尽了吧！之后就是给导师打电话，他很淡定，不过后面和我讨论的时候还是可以感觉到他的兴奋，呵呵

小结一下这篇稿子的心得：一、文章中审稿人提的问题如果不用加实验，只是加计算分析的话，最好采纳；我们二审后要求加算的数据其实一审中1#审稿人提到了，不过我们argue成功了，但是后来加审的3#审稿人还是不依不饶，提出同样的问题，假若第一次就算了，可能要轻松的多了。二、遇到像2#审稿人这样的，先找个树洞骂娘，然后心平气和地、一丝不苟地把所有他抓住的小辫子都剪掉，提出最重要的问题，也一定要圆满或者巧妙解决掉，不给他reject的机会！三、一定要自信，尤其是在写resubmission letter的时候，不能贬低自己的前一个版本的稿子，要让编辑和审稿人感觉到在咱的领域，咱就是professional，当然，不要有小辫子让编辑抓住；因为本次的实践证明，本稿的编辑是一个大牛培养教导并占领新institute的牛二代，所有文章中的细节他都门儿清。四、耐心、耐心、还是耐心！一篇像样的文章从开始做实验，补数据，再到数据分析，文章写作，反复修改定稿，投稿，以及根据审稿意见反复修改，每一步都要求沉下心来仔细地做，耐心的集齐所有“放烟花”的必备条件；本稿的材料是一个瓶颈，虽然咱导师前面已经收集到了大部分，但是我后来访问爱丁堡植物园的时候从哪里获取的材料又进一步将本文的材料体系推向close to perfect；实验后来加数据的时候大家也都在催，但是后来加完投出去之后审稿人在序列和材料上面没有提过一个字的问题，若不加的话，恐怕到时候补数据让人多少要范些大难，而且耽误的时间估计也不短；最重要的是，编辑有可能以此为借口reject！五、投稿之前一定要多找人改稿，这样可以保证所以行家能看到的问题和漏洞都已弥补或者打上补丁，把一般审稿人reject的理由全部清除掉或者回避掉，不给他们机会

罗罗嗦嗦就这么多，希望对大家有帮助！下面贴上审稿的具体日程：

一审：
Stage Start Date
Revision Received; Under Review 2011-12-31
Waiting for Revision 2011-11-17
Review Complete; E-Mail Notification Sent 2011-11-17
Pending Final Recommendation 2011-11-17
Manuscript Submission Undeleted 2011-09-01
Saved Partial Submission Withdrawn 2011-09-01
Quality Control Issue Identified 2011-09-01
Quality Control Review Started 2011-09-01
Author Approved Submission 2011-09-01
File Conversion Complete 2011-09-01

二审：
Stage Start Date
Revision Received; Under Review 2012-02-13
Waiting for Revision 2012-02-13
Review Complete; E-Mail Notification Sent 2012-02-13
Pending Final Recommendation 2012-02-06
Under Review 2012-01-04
Under Editor Review 2012-01-04
Under Editorial Board Review 2011-12-31
Author Approved Submission 2011-12-31
File Conversion Complete 2011-12-31

三审：
Stage Start Date
Manuscript Ready for Publication 2012-03-23
Review Complete; E-Mail Notification Sent 2012-03-23
Pending Final Recommendation 2012-03-21
Under Review 2012-03-08
Under Editor Review 2012-03-08
Under Editorial Board Review 2012-03-08
Author Approved Submission 2012-03-08
Waiting for Author Approval of Converted Files 2012-03-08
File Conversion Complete 2012-03-08
Preliminary Manuscript Information Submitted 2012-03-08
Saved Partial Submission Withdrawn 2012-02-13

但愿这篇小文的意义大过领到10个金币，因为我现在只有10个金币，前三之后估计没啥好发了！

祝大家身体健康，工作顺利，paper多多，funding多多！

Cactus586
思雨楼

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