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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 石墨烯纳米带 vasp建模 边缘如何加氢
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hpyang1989

木虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by llilanlanabc at 2012-03-27 11:01:38:
怎样加氢是不会写在paper里的吧，但是根据C是sp2杂化可以肯定H是加在纳米带平面上的，这点应该是毋庸置疑的，我知道的几个课题组都是这么做的，至于坐标，应该很好确定了吧

能提供下那几个课题组的文献么？ 嗯 加在纳米带平面上应该没错 但边缘有数十个原子 你有什么方便的方法加上吗？8楼说可以用ms 但是我不知道具体怎么操作 ms如何识别键的类型
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11楼2012-03-27 16:29:10
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fzx2008

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+2, 谢谢指教 2012-03-28 08:39:13
hpyang1989: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2012-03-28 10:21:51
直接采用MS中的加H工具！

因为石墨烯纳米带是平面结构，所以第一步务必保证杂化类型是sp2！MS中Modify Hybridization这个小按钮。然后再点击加H的按钮就可以了。

仔细看看MS的工具栏吧，bless you。
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hpyang1989
12楼2012-03-27 17:01:56
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hpyang1989

木虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
12楼: Originally posted by fzx2008 at 2012-03-27 17:01:56:
直接采用MS中的加H工具！

因为石墨烯纳米带是平面结构，所以第一步务必保证杂化类型是sp2！MS中Modify Hybridization这个小按钮。然后再点击加H的按钮就可以了。

仔细看看MS的工具栏吧，bless you。

非常感谢，但是我把碳原子都设置成sp2杂化  再加氢会加上3个氢 而且不在纳米带平面上 请问怎么解决呢？
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13楼2012-03-28 01:56:01
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fzx2008

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
hpyang1989: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-03-28 10:22:45
引用回帖:
13楼: Originally posted by hpyang1989 at 2012-03-28 01:56:01:
非常感谢，但是我把碳原子都设置成sp2杂化  再加氢会加上3个氢 而且不在纳米带平面上 请问怎么解决呢？

应该不会这样的，定是操作有误。

全选所有C原子，设成sp2，然后再加H试一遍。
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14楼2012-03-28 08:42:08
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hpyang1989

木虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by fzx2008 at 2012-03-28 08:42:08:
应该不会这样的，定是操作有误。

全选所有C原子，设成sp2，然后再加H试一遍。

搞定了 原来我没有设置键长的原因、、、 最后还有需要去除周期性边界条件 谢谢啦
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15楼2012-03-28 10:14:43
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shilonglee

金虫 (正式写手)
学习了……
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studyeveryday,happyeveryday,enjoyyourtimeandwhateverhappenspleasebelieveyoursel.f
16楼2012-03-29 22:20:09
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fyh987

金虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by fzx2008 at 2012-03-27 17:01:56:
直接采用MS中的加H工具！

因为石墨烯纳米带是平面结构，所以第一步务必保证杂化类型是sp2！MS中Modify Hybridization这个小按钮。然后再点击加H的按钮就可以了。

仔细看看MS的工具栏吧，bless you。

请问对其他体系如ZnO纳米线的加H操作也是一样吗
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努力挑战自己
17楼2012-03-30 10:26:08
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fzx2008

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
引用回帖:
17楼: Originally posted by fyh987 at 2012-03-30 10:26:08:
请问对其他体系如ZnO纳米线的加H操作也是一样吗

其它体系不一定能够加上，你可以试试看，估计MS程序内部有设定。

比如MS中切出的Ge纳米线，加H饱和悬挂键就无法加上。
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hanyanli0475
18楼2012-03-30 10:42:19
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fyh987

金虫 (小有名气)
引用回帖:
18楼: Originally posted by fzx2008 at 2012-03-30 10:42:19:
其它体系不一定能够加上，你可以试试看，估计MS程序内部有设定。

比如MS中切出的Ge纳米线，加H饱和悬挂键就无法加上。

谢谢LZ，得再摸索看看
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努力挑战自己
19楼2012-03-30 16:53:58
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terry52112

金虫 (小有名气)
MS直接加就行了！有个工具就是氢饱和的！
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新手上路请多关照
20楼2012-04-26 14:50:49
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