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guorongrong

铜虫 (正式写手)

[求助] 蛋白质结构域序列查找

已知一个蛋白质家族的保守结构域编号,怎么查找其序列?另外,怎么查找这个家族所有序列的保守结构域的序列?请各位老师指点。
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guorongrong

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tuobaohua at 2012-03-17 14:39:31:
去这里吧,专业分析。https://www.compbio.dundee.ac.uk/~www-jpred/
步骤:
1.1  进入JPred https://www.compbio.dundee.ac.uk/~www-jpred/
1.2  点击Prediction(Submit a protein sequence for secondary stru ...

您好,谢谢您的帮助,但是我输入了序列,怎么出来的不是这样的呀,它是和许多序列进行对比的,不能直接找出其保守序列
3楼2012-03-17 20:46:55
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tuobaohua

荣誉版主 (文坛精英)

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优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
wenjing120: 金币+2, 积极应助!华哥V5 2012-03-17 14:40:30
去这里吧,专业分析。https://www.compbio.dundee.ac.uk/~www-jpred/
步骤:
1.1  进入JPred https://www.compbio.dundee.ac.uk/~www-jpred/
1.2  点击Prediction(Submit a protein sequence for secondary structure prediction)
1.3  选择Email结果提交方式(建议)或留空为网页结果显示
1.4  输入蛋白质序列(原始序列)
1.5  选择File format的三个参数
1.6  点击Run提交
1.7  在邮箱中找到结果地址,并在弹出的结果显示界面选择第3项(Your results in HTML can be found here. )、第4项(A simple display of your query sequence and the prediction can be found here.)进行简单结果浏览、第5项(Postscript output can be found here.) 进行图形化输出


来自百度…………https://zhidao.baidu.com/question/1532132.html
2楼2012-03-17 14:39:31
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