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hlq3175

木虫 (正式写手)

[求助] [求助]有关guassian view 画图

我在用guassian做计算,要求画一个CO2和单乙醇胺共平面的图用于计算。根据文献要求CO2和N-C-C-O-H这几个原子必须共面,且符合Cs,我查到它表示C1h,即分子中有一个一次旋转轴和垂直于此轴的镜面对称元素,我就有点想不来是什么意思?谁能告诉一下图该怎么画呢?我觉得我这个里面的一次旋转轴貌似有很多,我想着是让那个C-C作为对称轴,然后让co2这个线性分子和C-C垂直,好像就可以做出来,可是我不确定这样是不是理解的对着?请各位大侠帮帮忙。

[ Last edited by hlq3175 on 2012-3-3 at 18:26 ]
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思雨G十年

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
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gmy1990(金币+2): 2012-03-03 22:47:41
你让NCCOH共面容易吧 再让一条直线的CO2与之共面还有难度?
要以感性的思想和认识,理性的思考和行动对待科研。
2楼2012-03-03 18:42:53
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思雨G十年

金虫 (正式写手)

图这样画不行?

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要以感性的思想和认识,理性的思考和行动对待科研。
3楼2012-03-03 18:47:44
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hlq3175

木虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by 思雨G十年 at 2012-03-03 18:42:53:
你让NCCOH共面容易吧 再让一条直线的CO2与之共面还有难度?

让它们共面很容易,但是我发现随着CO2和单乙醇胺的相对位置不同(指的是他们的二面角)他们最后优化再做后续计算的值是不一样的,所以我猜想是我把那个Cs没有搞清楚,能解释一下吗?
4楼2012-03-03 18:52:01
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hlq3175

木虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by 思雨G十年 at 2012-03-03 18:47:44:
图这样画不行?
09/4e/807115_1330771652_152.png
1
09/4e/807115_1330771652_701.png
2
1f/ee/807115_1330771653_482.png
3

单乙醇胺是NH2-CH2-CH2-OH,我做的优化是要固定N和CO2中C的距离,这样子貌似没法保证呀~
5楼2012-03-03 18:55:00
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350735697

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
hlq3175(金币+6): ★★★很有帮助 谢谢您,不过我有个疑问,当我把CO2或者单乙醇胺的二面角或者相对位置改变以后,进行优化在做单点处理,发现最终所要的结果是不一样的,因为我固定了几个二面角进行的后续处理,貌似需要我找到一个最佳的结构和位置关系才能再继续做后续计算,请问有什么办法可以简化这个寻找的过程吗?? 2012-03-04 12:49:03
hlq3175(金币+3): ★★★★★最佳答案 谢谢您的建议,我根据您说的差不多找到规律了。 2012-03-09 13:33:53
hlq3175(金币+1): 2012-03-09 13:35:42
Cs就是C1h,就是分子有一个一次旋转轴和一个垂直于这个轴的面。其实就相当于分子有一个对称面。就是指这几个原子共面就行,其余原子对称分布在对称面两侧。二氧化碳三个原子所在直线和单乙醇胺中的C,N原子所在直线不一定共线,只用共面即可。这样CO2中的C于单乙醇胺中的N原子距离固定后,它们的夹角可以调整,即调整它们的相对位置。
6楼2012-03-04 12:33:23
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思雨G十年

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by hlq3175 at 2012-03-03 18:55:00:
单乙醇胺是NH2-CH2-CH2-OH,我做的优化是要固定N和CO2中C的距离,这样子貌似没法保证呀~

有固定键长和位置的keyword,你自己查一下高斯说明书
要以感性的思想和认识,理性的思考和行动对待科研。
7楼2012-03-09 12:07:24
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hlq3175

木虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by 思雨G十年 at 2012-03-09 12:07:24:
有固定键长和位置的keyword,你自己查一下高斯说明书

恩,谢谢,这个问题我已经解决了。
8楼2012-03-09 13:35:22
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