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bjmaowei25

铜虫 (小有名气)

[求助] Handson2 SUMMARY.fcc

请问哪位前辈,运行过Handson2.tgz   中的第一个2_1_fccSi   例子
其中loop.sh文件,当运行 vasp完命令, loop.sh是自动运行的吗?
本人在运行完vasp命令, loop.sh好像根本就没有运行,因为看不到
SUMMARY.fcc文件。 只有当手动的运行,才产生SUMMARY.fcc文件,
自动点击运行的结果如下,但也更Hands on Session II结果不一样啊,期待
哪位运行过的前辈能指点一下。



3.5 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
3.6 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
3.7 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
3.8 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
3.9 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
4.0 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
4.1 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
4.2 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
4.3 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
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追求真理
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bjmaowei25

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by likai0106 at 2012-02-21 14:05:47:
楼主有误区,loop.sh是一个脚本命令运行的是sh loop.sh这个命令
vasp命令是被loop.sh命令调用的。

谢谢,是这样啊!
前辈的意识 我是先运行 vasp 命令,再运行sh loop.sh ?
还是别的呢?
我照上面做的 先运行 vasp 命令,再运行sh loop.sh,
虽然得到SUMMARY.fcc文件,但是结果与Hands on Session II结果不一样。
如果想得到与Hands on Session II结果,应该怎样操作呢?

望请赐教。

结果如下;
$ vasp
vasp.4.6.28 25Jul05 complex
POSCAR found :  1 types and    1 ions
LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
WARNING: wrap around errors must be expected
FFT: planning ...           1
reading WAVECAR
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
DAV:   1    -0.278431497922E+01   -0.27843E+01   -0.10326E+03   732   0.272E+02
DAV:   2    -0.457804952176E+01   -0.17937E+01   -0.16606E+01   966   0.262E+01
DAV:   3    -0.459689759677E+01   -0.18848E-01   -0.18606E-01   816   0.264E+00
DAV:   4    -0.459692216630E+01   -0.24570E-04   -0.24569E-04   990   0.101E-01
DAV:   5    -0.459692220398E+01   -0.37683E-07   -0.37928E-07   786   0.275E-03    0.643E-01
DAV:   6    -0.458766543052E+01    0.92568E-02   -0.48053E-03   768   0.394E-01    0.379E-01
DAV:   7    -0.458301006453E+01    0.46554E-02   -0.96545E-03   720   0.555E-01    0.278E-02
DAV:   8    -0.458300850541E+01    0.15591E-05   -0.61218E-05   714   0.667E-02
   1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01  d E =-.386612E-02
writing wavefunctions
[mao@localhost 2_1_fccSi]$ sh loop.sh
a= 3.5
loop.sh: line 15: ~vw/bin/vasp: No such file or directory
a= 3.6
loop.sh: line 15: ~vw/bin/vasp: No such file or directory
a= 3.7
loop.sh: line 15: ~vw/bin/vasp: No such file or directory
a= 3.8
loop.sh: line 15: ~vw/bin/vasp: No such file or directory
a= 3.9
loop.sh: line 15: ~vw/bin/vasp: No such file or directory
a= 4.0
loop.sh: line 15: ~vw/bin/vasp: No such file or directory
a= 4.1
loop.sh: line 15: ~vw/bin/vasp: No such file or directory
a= 4.2
loop.sh: line 15: ~vw/bin/vasp: No such file or directory
a= 4.3
loop.sh: line 15: ~vw/bin/vasp: No such file or directory
3.5 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
3.6 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
3.7 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
3.8 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
3.9 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
4.0 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
4.1 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
4.2 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
4.3 1 F= -.45830085E+01 E0= -.45810754E+01 d E =-.386612E-02
追求真理
3楼2012-02-21 16:13:44
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bjmaowei25

铜虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by likai0106 at 2012-02-21 16:46:30:
不用单独运行vasp,你的vasp命令是集成在loop.sh中了,直接运行sh loop.sh就行了。你提示错误的原因是loop.sh中没有找到你计算机下的vasp的邮箱路径。如果你的vasp在/bin下面的话,你就打开loop.sh修改里面的~/v ...

谢谢你的回复,
根据你的提示修改 BIN,结果成功输出,谢谢了!
追求真理
5楼2012-02-22 10:45:03
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普通回帖

likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
fzx2008(金币+1): 谢谢指教 2012-02-21 14:50:52
楼主有误区,loop.sh是一个脚本命令运行的是sh loop.sh这个命令
vasp命令是被loop.sh命令调用的。
2楼2012-02-21 14:05:47
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likai0106

金虫 (小有名气)


贺仪(金币+1): 谢谢参与讨论 2012-02-22 10:45:18
引用回帖:
3楼: Originally posted by bjmaowei25 at 2012-02-21 16:13:44:
谢谢,是这样啊!
前辈的意识 我是先运行 vasp 命令,再运行sh loop.sh ?
还是别的呢?
我照上面做的 先运行 vasp 命令,再运行sh loop.sh,
虽然得到SUMMARY.fcc文件,但是结果与Hands on Session II结果不 ...

不用单独运行vasp,你的vasp命令是集成在loop.sh中了,直接运行sh loop.sh就行了。你提示错误的原因是loop.sh中没有找到你计算机下的vasp的邮箱路径。如果你的vasp在/bin下面的话,你就打开loop.sh修改里面的~/vasp路径,把他直接改成vasp就行了。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2012-02-21 16:46:30
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wd12309812

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by likai0106 at 2012-02-21 16:46:30
不用单独运行vasp,你的vasp命令是集成在loop.sh中了,直接运行sh loop.sh就行了。你提示错误的原因是loop.sh中没有找到你计算机下的vasp的邮箱路径。如果你的vasp在/bin下面的话,你就打开loop.sh修改里面的~/vas ...

请问,vasp路径没有问题,但是输出

/home/app/vasp533.om: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory

什么原因,并行库出现问题吗?
怎么解决啊
6楼2015-08-20 11:35:22
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