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alwens

铁杆木虫 (正式写手)


[资源] 免费版MOPAC2007(XP版)

MOPAC 早先作为免费软件发布,最高版本为MOPAC 7.0。此后成为商业软件。最近传来好消息,MOPAC2007重新对学术免费!!
MOPAC2007 (version 7.051) released 20th February 2007

     - NEW PM6 parameterization

     - More accurate heats of formation & geometries

     - ALL main group elements, transition metals, & Lanthanides

     - Serious errors from PM3 and AM1 corrected

     - Crystals, surfaces & polymers with periodic boundaries

     - FREE to academics

     - Visit www.MOPAC2007.com for more information

MOPAC, has been completely rewritten from the ground up with a new and more accurate parameterization (PM6) for all the main group elements and transition metals.  Some additional elements have also been parameterized for PM3 and AM1.  The author, Jimmy Stewart, collected experimental and ab initio data from over 9,000 compounds to parameterize the new PM6 method.  PM6 represents the first major improvement in methodology to MOPAC since PM3 was released in 1989.

The latest MOPAC2007 release is available for download at www.MOPAC2007.com , and is FREE for academics. Updated versions will be made available for download at regular intervals.

MOPAC 是世界上最广泛使用的半经验量化程序,用于研究气体,溶液和固体的化学特性,包括Gibbs自由能,活化能,反应路径,偶极矩,非线性光学特性以及红外光谱等。它还可以用做为结构-特性(或活性)定量的基础,预测生物学及其它特性,包括致癌性,蒸汽压,水溶解性,反应率等。
MOPAC中获取专利的MOZYME 算法可以使那些在超级计算机上需要几天或者几周的计算,在PC 机上仅需要几分钟。对于包含上千原子的体系,诸如蛋白质,聚合物,半导体和晶体,它们的电子特性计算仅仅需要几分钟或几小时。此外,MOPAC 还包含用于光谱计算的半经验分子轨道程序MOS-F 模块(目前版本是5.0)。MOPAC 和MOS-F 本身并不包含图形用户界面,但可以和CAChe,LinMOPAC,WinMOPAC,HyperChem 或CS Chem3D 等图形用户界面的程序结合使用。

MOPAC
1. 计算方法有:在MOPAC 中有:AM1,AM1-d,PM3,MNDO,MNDO-d,MINDO/3;
在MOS-F 中有:CNDO/2,CNDO/S,CNDO/S2,CNDO/S3,INDO/S。
2. 可以进行的计算有:几何优化,过渡态结构,激发态结构,线性比例SCF 计算(MOZYME方法),反应坐标能量图,热构成(气相或溶液),简正模式振动分析,溶剂特性(气相,水,辛醇,等),IR 光谱,原子电荷,极化率,偶极矩,分子轨道,电子密度,梯度范数,力,能量分配,ESP 原子电荷,键序,参量化分子静电势,体系间交叉结构,氨基酸片断顺序的结构分析,IRC/DRC。
3. 支持的输入文件格式:MOPAC,MOS-F,Gaussian 输入文件(*.gjf),Gaussian fchk 文件(*.fch),Cartesian 文件(*.car),PDB。
4. XMO 工具可以显示分子。
MOS-F
1. 进行半经验分子轨道方法INDO/S,CNDO/S,CNDO/S2,CNDO/S3 和CNDO/2 等的计算。
2. 单电子激发组态相互作用(CIS)的光谱计算,支持单重激发态和三重激发态。CIS 还能计算激发态的电子密度和电偶极矩。
3. 随机相位近似(RPA)的光谱计算。
4. 分子特性计算:含频率极化率,静态第一超极化率,电-光泡克尔效应,产生二次谐波,光学检波,静态第二超极化率,包含克尔效应的直流电场,包含二次谐波的直流电场,产生三次谐波,简并四波混频,包含光学检波的直流电场。
5. 用Onsager 模型进行SCRF 计算,预测溶液中的分子特性:CIS/RPA 波函的电子光谱;用CIS 波函预测激发态的电子密度和电偶极矩;用CIS 波函计算含频率极化率,第一超极化率,和第二超极化率。
6. 解析的Pariser-Parr,Nishimoto-Mataga,Nishimoto-Mataga-Weiss,Ohno,Ohno-Klopman,和DasGupta-Huzinaga 公式,用于求解双中心电子排斥积分。
7. 支持的坐标输入格式有Gaussian 型Z 矩阵和MOPAC 内坐标。
8. 到WinMOPAC 的输入/输出接口。
9. 对溶质,自动计算空穴半径;通过指定溶剂名称,自动设置介电常数和折射率。
10. 改善SCF 收敛的DIIS 方法。
11. 转动常数;惯量主轴和偶极矩的夹角。
MOPAC2002 V1.5和WinMOPAC 3.9的新功能:
1. MINDO,AM1,PM3,PM5新增加对13种过渡金属(Sc,Ti,V,Cr,Fe,Co,Ni,Cu,Zr,Mo,Pd,Ag,Pt)的支持。
2. MOS-F模块升级到6.0。可以用AM1,PM3,PM5计算电子光谱,支持更多的元素;考虑溶剂影响;计算极化率和超极化率;直接SCF方法;快速的直接四指数积分变换方法。
3. 线性标度COSMO方法,能够对大分子进行COSMO计算。
MOPAC2006 1.0新增功能:
MOS-F模块:ROHF + CIS计算开壳层分子激发态,QM/MM-CIS/RPA计算生物大分子的激发态,INDO/S新增对Li, F, Mg, Si, P, S, Zn的支持,LAPACK提高了矩阵对角化计算的速度。
MOPAC模块:单点、几何优化、振动频率和COSMO实现并行,周期边界条件。

[ Last edited by zzgyb on 2008-3-28 at 10:22 ]
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dota

木虫 (著名写手)


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ding ding!
2楼2007-03-01 00:53:18
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★★★★★ 五星级,优秀推荐

支持一下,不过这个不同于那个商业的 MOPAC2002
也不是从那个 MOPAC2002 转过来的,也就是说不是它的后继版本,两者之间还是有很大的区别的

另外,这个版本中不包括 MOS-F....
3楼2007-03-01 09:55:10
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引用回帖:
Originally posted by snoopyzhao at 2007-3-1 09:55 AM:
支持一下,不过这个不同于那个商业的 MOPAC2002
也不是从那个 MOPAC2002 转过来的,也就是说不是它的后继版本,两者之间还是有很大的区别的

另外,这个版本中不包括 MOS-F....

麻烦您能再详细说说吗?
4楼2007-03-01 11:26:42
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shenyudong

金虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

好像需要密码,不知这个问题如何解决?
5楼2007-03-01 11:32:41
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我还在申请密码?邮件都通了2次了,还要填一个单,再等。
6楼2007-03-01 12:02:47
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alwens

铁杆木虫 (正式写手)


嗯,要申请个license,网站很快会发到你的邮箱中。
下面是装license key的方法:

Password:  647275a15901764


           How to install the license key or password for MOPAC2007


WINDOWS users:
   Create a folder under "C:\Program Files" called "MOPAC"
   That is, create "C:\Program Files\mopac".
   Put the MOPAC2007.exe executable in "C:\Program Files\mopac\".


Linux users:
   As superuser (root), create a subdirectory "/opt/mopac/"
   Set the permissions of"/opt/mopac/" to r--r--r--, i.e. 444
   (a suitable command would be "chmod 444 /opt/mopac/"
   Put the MOPAC2007 executable in "/opt/mopac/" and re-name it to "mopac".
   Set the permissions of"/opt/mopac/mopac" to  --x--x--x, i.e. 111
   (a suitable command would be "chmod 111 /opt/mopac/mopac"


1. Create a MOPAC data set file with the name:  647275a15901764.mop

2. Run that data set using the new MOPAC.  When MOPAC starts, it should generate
   the End User License Agreement.  You will need to press (return) one or more times to
   get to the end.  You might need to scroll down to see the bottom part.  
   At the bottom ofthe EULA, you will be asked to type in "yes" or "no".

   If you type "yes" you should get a message confirming that the license key
   for MOPAC2007 has been correctly installed.

3. MOPAC2007 is now functional.  It should run for 366 days.
7楼2007-03-01 13:11:37
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我申请的密码也来了,和楼上的有点区别。呵呵,楼上的快了点啊。
8楼2007-03-01 13:17:42
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chemplayer

银虫 (小有名气)


http://www.mopac2007.com/ 怎么打不开啊? 申请不到 密码 啊?进http://www.openmopac.net/./Download_MOPAC_Executable_Step2.html 打开了。 谢谢,申请密码中!

[ Last edited by chemplayer on 2007-3-1 at 19:19 ]
9楼2007-03-01 19:11:02
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引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2007-3-1 11:26 AM:


麻烦您能再详细说说吗?

MOPAC2002 的主要作者与 Mopac2007 的主要作者是同一个人,但前者是商业软件,其前身是 MOPAC2000,再往前是 MOPAC97, MOPAC93。就源代码的相似程序来说,MOPAC93 与这里提到的 Mopac2007 是类似的,都是基于 MOPAC 7.0 (这是一个 public domain 的软件)。Mopac2007 只是在 MOPAC 7.0 的基础上加入了 PM6 与 RM1 并且修正了一些错误,等等

MOPAC 2002 中有 PM5,这是 Mopac2007 中没有的,也不会有,呵呵……

另外,商业版的 MOPAC2002 软件包还带有 MOS-F,这个前面也有介绍,但这个在 Mopac2007 中也没有,呵呵……

我想说的是,Mopac2007 与 MOPAC2002 不具有版本上的可比性,也不是后者的升级版本
10楼2007-03-01 20:55:54
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★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢谢!试一试先
11楼2007-03-02 11:36:01
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xufund

至尊木虫 (知名作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

LZIS VERY KIND!
THANKS!
12楼2007-03-02 20:06:58
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王孝仕

金虫 (著名写手)


请问可以用到chemoffice2006中使用吗?
13楼2007-03-09 13:47:53
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dota

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by 王孝仕 at 2007-3-9 01:47 PM:
请问可以用到chemoffice2006中使用吗?

我试过,可以!

按说明把那两个文件建立在 ~/ChemOffice2006/Common/COEA/ 目录下面,并把 Mopac2007.exe 该名为 MopacPro.exe 。
14楼2007-03-09 14:08:39
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王孝仕

金虫 (著名写手)


dota,太谢谢你了!但是为什么要“把 Mopac2007.exe 该名为 MopacPro.exe 。 ???
15楼2007-03-09 19:32:13
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王孝仕

金虫 (著名写手)


是不是因为chem-3D的MOPAC的interface只能认识MOPACPRO.exe?
16楼2007-03-09 19:36:27
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dota

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by 王孝仕 at 2007-3-9 07:36 PM:
是不是因为chem-3D的MOPAC的interface只能认识MOPACPRO.exe?

是地~~~
17楼2007-03-10 01:18:33
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zxdhxx

铁杆木虫 (正式写手)


18楼2007-03-10 07:47:18
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zhotihu

木虫 (正式写手)


★ 一星级,一般

为何运行时显示windows 关闭呢?
19楼2007-04-05 10:00:49
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xuqq

银虫 (初入文坛)


chemoffice2006i中不是有自带的吗
20楼2007-04-17 10:14:13
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haoming_0027


我的点数不够啊

麻烦 楼主 给我发过来 这个 程序吧,我急需啊,谢谢了 ,我的邮箱是haoming_0027@163.com
21楼2007-06-30 15:00:08
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zengchunling01

捐助贵宾 (著名写手)


谢谢啊

我怎么连接不上啊
楼主能将程序传我一份不
谢谢:zengchunling01@163.com
23楼2007-12-13 13:35:06
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简单回复
2007-07-23 10:19   回复  
 
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