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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » CPMD/CP2K » 第一原理动力学的系综选择，和各种系综的输入文件Example
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一声叹息010

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by ChemiAndy at 2012-02-17 03:07:12
手册建议是大于3倍,以免它们之间形成耦合.

这里选择NOSE ELECTRONS的耦合频率25000cm-1，大概是每1个fs就让电子储热罐与体系交换一次能量，即耦合一次。这个频率的确很高，目的是希望电子动能的波动小一些。不过 ...

“容易出问题”，是是的什么问题呢，能举个例子吗？
“如果碰到NaN了，可把NOSE ELECTRONS调大一些试试。”可是根据我的实际，大的电子耦合频率才会NAN，调小点反而没有NAN了，和楼主的说法刚好相反呢！
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静则无息，动则无敌
11楼2013-06-09 21:46:14
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
11楼: Originally posted by 一声叹息010 at 2013-06-09 21:46:14
“容易出问题”，是是的什么问题呢，能举个例子吗？
“如果碰到NaN了，可把NOSE ELECTRONS调大一些试试。”可是根据我的实际，大的电子耦合频率才会NAN，调小点反而没有NAN了，和楼主的说法刚好相反呢！...

我的计算出现过NaN，还没有明白是怎么回事。
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12楼2013-06-10 08:18:19
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luzihen

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我说这个帖子是精化
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13楼2016-03-30 22:28:12
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future_wl

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问做第一性原理的MD之前是不是也应该结构优化？优化时是否应该先NPT，不固定体积，让结构充分驰豫，得到稳定结构之后再用NVT或者NVE进行动力学模拟？
谢谢！
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未来就是现在
14楼2021-12-01 10:07:37
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