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ONIOM优化,l9999后restart报错
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ONIOM B3LYP/6-31G*优化一个大分子(约7000原子),两层,high layer(QM)约有70原子,是一个较大的体系。坐标用的是Z-Matrix。 使用的关键词如下 # oniom(b3lyp/6-31g(d):amber=hardfirst) nosymm opt=(ts,calcfc,noeigentest,maxcycles=5000) geom=connectivity iop(2/15=3) test 最终以l9999报错,原因是没有收敛。NStep=444(即做了444次),这对于很多做Gaussian优化来说好像步数已经太多了,不过做那么大体系的ONIOM,用的又是B3LYP,还真没底。查看能量,是呈一个下降的趋势,然后判断收敛的几个数值也是朝着减小的方向走。自己认为再加一些循环次数就能够收敛。 然后想restart,我用的Gaussian 09。我直接把上面那行关键词改成 # oniom(b3lyp/6-31g(d):amber=hardfirst) nosymm opt=restart geom=connectivity iop(2/15=3) test 当然,chk文件保持不变。 结果……就报错了: All quantities printed in internal units (Hartrees-Bohrs-Radians) MOMM, but no IMMCRS Error termination via Lnk1e in /home/zjw/g09/l103.exe at Wed Feb 15 14:15:56 2012. 然后上网搜索这个错误……无果。也有人提问过,同是做ONIOM的,但就是没有人回答。 问问这里有人碰到过吗?有人知道是怎么回事吗? 或者,这里有做大分子体系ONIOM的人吗? 先感谢。 |
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2楼2012-02-16 22:46:12
mophyworld
金虫 (正式写手)
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【答案】应助回帖
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minatomirai(金币+2): ★有帮助 好的,非常感谢这条建议! 2012-02-19 06:29:34
minatomirai(金币+2): ★有帮助 好的,非常感谢这条建议! 2012-02-19 06:29:34
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没做过ONIOM,但是之前做优化时,用restart一开始计算就出错,在网上搜索过后,听说是G09的restart任务需要有.chk和rwf文件才可以进行。所以我在之后做优化时都会把rwf文件保存下来。但是,后来做任务时,出现优化步数已经达到最大值,使用opt(restart, maxcycle=***)关键字又出现RdWrOT: Data mismatch on MaxStp/MaxJob问题,即设定的maxcycle超过程序给出的maxcycle最大值的问题,后来的解决方式是提取之前优化出现错误时最后一次计算的结构,然后重新开始优化计算而不是使用opt(restart),结果在继续优化后不久结构优化即完成了。 以上是一点经验,希望对您有所帮助。 |

3楼2012-02-18 10:31:41











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