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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » 新手求教pw算声子譜提示缺少.dyn1文件
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xhzha

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 新手求教pw算声子譜提示缺少.dyn1文件

大家好，我刚学习pw，模仿例子写些简单输入文件算声子色散曲线。用ph.x生成了。.dyn0文件，没有.dyn1文件。接下来用qr2.x时就报错说少了.dyn1文件。都在同一目录下进行的计算。而且在写输入文件命名都是一致的.dyn文件，没有指明0和1.问题出在哪呢，希望虫友帮忙解答下。附上输入文件。

ps：这0和1表示什么意思呢？还有我想算一个结构的声子谱，然后通过固定晶格的方法对它进行压缩和拉伸，固定晶格的体系也优化后，进行算声子谱。siesta是可以实现的，但消虚频还是有些困难，要求比较大的超晶格和很高精度，对于我们的小服务器太耗时。想换线性响应的方法试试。对于固定晶格优化，pw应该是可以实现的吧？谢谢
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  • 附件 1 : ZnO.pw.in
    • 2012-02-15 14:29:14, 1.31 K
  • 附件 2 : ZnO.ph.in
    • 2012-02-15 14:29:14, 649 bytes
  • 附件 3 : ZnO.q2r.in
    • 2012-02-15 14:29:20, 102 bytes

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1楼 2012-02-15 14:29:55
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gemucai

木虫 (正式写手)
WDD880227(金币+1): 感谢提示 2012-02-16 09:25:49
固定晶格使其受力算声子谱，我用PWSCF算过很多次，这个是没问题的。

我大概看了一下你的输入文件，应该没什么错误，可能就是计算过程中任务跳出来了。0和1其实并不代表太多意思，就是动力学矩阵太长了，把它分开写而已。缺少*.dyn1说明还没算完。
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2楼2012-02-16 09:15:25
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xhzha

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by gemucai at 2012-02-16 09:15:25:
固定晶格使其受力算声子谱，我用PWSCF算过很多次，这个是没问题的。

我大概看了一下你的输入文件，应该没什么错误，可能就是计算过程中任务跳出来了。0和1其实并不代表太多意思，就是动力学矩阵太长了，把它分 ...

非常感谢。你可不可以将我的输入文件用你的服务器算下，我重新提交了好多次还是不行。我想确定下是不是我的服务器的问题。

ps：请点应助，我这样给不了金币。
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3楼2012-02-16 13:03:34
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gemucai

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
xhzha(金币+20): ★有帮助 2012-02-16 22:04:14
sunyang1988(金币+2): 谢谢指点 2012-02-17 09:13:51
xhzha(金币+30): 2012-02-24 09:37:30
引用回帖:
3楼: Originally posted by xhzha at 2012-02-16 13:03:34:
非常感谢。你可不可以将我的输入文件用你的服务器算下，我重新提交了好多次还是不行。我想确定下是不是我的服务器的问题。

ps：请点应助，我这样给不了金币。

跑了一遍，终于知道你错在哪儿了。
ZnO.q2r.in的第二行是&input，后面不要加ph
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4楼2012-02-16 19:09:41
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xhzha

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by gemucai at 2012-02-16 19:09:41:
跑了一遍，终于知道你错在哪儿了。
ZnO.q2r.in的第二行是&input，后面不要加ph

谢谢，这确实是我的粗心。不过问题好像不是出在这，我更改之后重新跑，还是提示相同的错误。你能跑完么？
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5楼2012-02-16 22:06:03
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gemucai

木虫 (正式写手)
sunyang1988(金币+2): 谢谢交流 2012-02-18 00:11:52
引用回帖:
5楼: Originally posted by xhzha at 2012-02-16 22:06:03:
谢谢，这确实是我的粗心。不过问题好像不是出在这，我更改之后重新跑，还是提示相同的错误。你能跑完么？

可以跑完的，我分别用单核和多核都跑过。一共有13个动力学矩阵文件：*.dyn0到*.dyn12。
最后算得的ZnO444.fc贴在附件上了。记住，并行的话要在ZnO.pw.in的&control里面设置wf_collect=.true.
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  • 附件 1 : ZnO444.fc
    • 2012-02-17 14:00:57, 299.79 K
6楼2012-02-17 14:02:29
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xhzha

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by gemucai at 2012-02-17 14:02:29:
可以跑完的，我分别用单核和多核都跑过。一共有13个动力学矩阵文件：*.dyn0到*.dyn12。
最后算得的ZnO444.fc贴在附件上了。记住，并行的话要在ZnO.pw.in的&control里面设置wf_collect=.true.

我按照你所说的做了，可是就是跑不完，只有dyn0文件。呵呵，很无奈啊，不知道会不会是安装的问题，关键它还是能跑一段的。要不你把你算得这几个输入文件给下我吧，我仔细的对比下可还有什么不同。非常感谢你的热心回复。
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7楼2012-02-17 18:24:55
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gemucai

木虫 (正式写手)
我用的就是你的输入文件，只不过是改了改目标路径和并行设置。我把输入输出文件都贴出来，可以照着跑一下看看。

小木虫好像不太喜欢.zip文件，你下载附件过后把下划线改成点就可以解压了。
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  • 附件 1 : ZnO.zip
    • 2012-02-18 16:06:03, 434.39 K
8楼2012-02-18 16:07:01
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xhzha

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by gemucai at 2012-02-18 16:07:01:
我用的就是你的输入文件，只不过是改了改目标路径和并行设置。我把输入输出文件都贴出来，可以照着跑一下看看。

小木虫好像不太喜欢.zip文件，你下载附件过后把下划线改成点就可以解压了。

估计是我服务器的问题，用的是管理员再公共目录下的软件，还是算不完就停了。估计得自己重新装下了，谢谢你。
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9楼2012-02-21 09:43:44
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xhzha

铁杆木虫 (正式写手)
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楼: Originally posted by gemucai at 2012-02-18 16:07:01:
我用的就是你的输入文件，只不过是改了改目标路径和并行设置。我把输入输出文件都贴出来，可以照着跑一下看看。

小木虫好像不太喜欢.zip文件，你下载附件过后把下划线改成点就可以解压了。

点个应助，我把金币都给你吧，呵呵
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10楼2012-02-21 09:44:59
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