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zhaogz

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

zhang8826857(金币+1): 鼓励交流 2012-02-16 09:50:25
391579557: 回帖置顶 2012-02-16 10:13:29
391579557: 取消置顶 2012-02-16 10:15:21
种属鉴定只需提取菌株DNA,扩增16 S rRNA基因并测序,最后完成序列比对即可。
11楼2012-02-16 09:39:55
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391579557

木虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by 1104水 at 2012-02-16 09:04:55:
鉴定种属自己可以做啊,先从形态学上,再从分子生物学,提取DNA,PCR扩增ITS序列,然后送到测序公司测序,到NCBI数据库比对,就差不多了,测个序,没多少钱。

实验室条件不满足啊,没有PCR啊。
求实,所以来小木虫!
12楼2012-02-16 10:11:33
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丰之第

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

zhang8826857(金币+1): 鼓励交流 2012-02-18 10:15:23
我以为你要鉴定新种,如果不是鉴定新种的话,直接16srRNA引物PCR扩增,回收,拿去测序,NCBI比对,就知道了。
13楼2012-02-16 15:37:11
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391579557

木虫 (正式写手)

为什么不能评分?!~~~~~
求实,所以来小木虫!
14楼2012-02-16 16:01:57
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weileh

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
zhang8826857(金币+3): 鼓励交流 2012-02-18 10:15:31
cpi试剂条好像不便宜哦,还要做分子估计500做不下来的,CICC有资质的单位,给出相应的报告很详细的。上海生工估计就是做分子的东东,自己都可以作的提取DNA,PCR扩增ITS序列,然后送到测序公司测序,到NCBI数据库比对,做系统发育树,就鉴定到属了~省钱多了
15楼2012-02-16 16:26:31
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李寡人

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 391579557 at 2012-02-16 08:47:16:
如果只需要种属,后面的是不是可以不做啊?

其他化学指标很重要,么有的话文章肯定是不会收的(我老板是审稿人)
其他理化指标,培养特征,扫描电镜照片作为信息补充也是需要的
16楼2012-02-17 09:04:20
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wu0519

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
zhang8826857(金币+5): 鼓励交流 2012-02-18 10:15:40
我最近在生工测了几株真菌,快被气晕了,每株菌的结果好多个属,BLAST比对相似率差不多才80%,根本不能用,打电话过去上海生工问,人家理直气壮说你的DNA没提好,(我们是直接送的DNA,他们负责PCR,并BLAST,就这些,一株真菌300)我说DNA没提好,你ITS怎么P出来条带的呀,况且鉴定出来这么多的属,根本白花了钱不能用呀,人家来一句我不管,说让做克隆,一株510。我气得都不知道该怎么说,以前读本科的学校是在华大基因测的,人家测不出来准确结果是不收费的,还望楼主慎重考虑,被上当了!!!
17楼2012-02-17 17:04:10
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丰之第

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
13楼: Originally posted by 丰之第 at 2012-02-16 15:37:11:
我以为你要鉴定新种,如果不是鉴定新种的话,直接16srRNA引物PCR扩增,回收,拿去测序,NCBI比对,就知道了。

你是哪里的?要不送到大学实验室去,要别人帮你PCR,测序就可以了。
18楼2012-02-18 16:39:25
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snowfox0323

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个主要是看你做什么东西了,如果你只是一般的菌株做鉴定的话那只要做分子鉴定就行,还有如果是放线菌的话PCR做16s,不是做ITS的,如果测序后比对是一个新种的话,那有必要做BIOLOG等,为了确定这株菌的分类学地位,一般用于发文章。CICC有资质,他给你鉴定的证书拿到哪人家都承认,就是说你相当于是拿钱买了一张证书,生工只是一般的公司,如果你自己提取DNA,做PCR的话,把片段给他们测序只要30块钱,不过生工测序比较烂。上海有好几家测序的,不行送到华大也比生工好~
中科院背景,承接生物,能源,化工等各类横向合作,申请课题,申请政府资金cool.323@163.com
19楼2012-03-09 14:48:42
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QQ84508540

捐助贵宾 (小有名气)

强迫症患者

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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391579557: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-03-22 17:15:12
CICC做的是非常全面的鉴定。
而上海生工500元做的是真菌的分子生物学鉴定,400元做细菌分子鉴定,这个价位仅仅测真菌的ITS(18s)区和细菌的16s区的测序,都是保守序列。测序后通过提交到BLAST与其他基因比对,做系统进化树,找到相近的物种,从而确定菌种名称。这种方法比较简便,经济,实用。如果你发现某一新种,或者需要申请专利,或有什么特殊功能,那就要做全序列测定,费用上万。
★★★★★从☆小☆学☆生☆做☆起!★★★★★
20楼2012-03-15 01:02:33
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