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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 菌种鉴定的费用悬殊？鉴定内容却…？请教各位前辈啊。
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zhaogz

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

zhang8826857(金币+1): 鼓励交流 2012-02-16 09:50:25
391579557: 回帖置顶 2012-02-16 10:13:29
391579557: 取消置顶 2012-02-16 10:15:21
种属鉴定只需提取菌株DNA，扩增16 S rRNA基因并测序，最后完成序列比对即可。
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11楼2012-02-16 09:39:55
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391579557

木虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by 1104水 at 2012-02-16 09:04:55:
鉴定种属自己可以做啊，先从形态学上，再从分子生物学，提取DNA，PCR扩增ITS序列，然后送到测序公司测序，到NCBI数据库比对，就差不多了，测个序，没多少钱。

实验室条件不满足啊，没有PCR啊。
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求实，所以来小木虫！
12楼2012-02-16 10:11:33
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丰之第

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

zhang8826857(金币+1): 鼓励交流 2012-02-18 10:15:23
我以为你要鉴定新种，如果不是鉴定新种的话，直接16srRNA引物PCR扩增，回收，拿去测序，NCBI比对，就知道了。
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13楼2012-02-16 15:37:11
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391579557

木虫 (正式写手)
为什么不能评分？！~~~~~
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求实，所以来小木虫！
14楼2012-02-16 16:01:57
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weileh

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
zhang8826857(金币+3): 鼓励交流 2012-02-18 10:15:31
cpi试剂条好像不便宜哦，还要做分子估计500做不下来的，CICC有资质的单位，给出相应的报告很详细的。上海生工估计就是做分子的东东，自己都可以作的提取DNA，PCR扩增ITS序列，然后送到测序公司测序，到NCBI数据库比对，做系统发育树，就鉴定到属了~省钱多了
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15楼2012-02-16 16:26:31
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李寡人

金虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 391579557 at 2012-02-16 08:47:16:
如果只需要种属，后面的是不是可以不做啊？

其他化学指标很重要，么有的话文章肯定是不会收的（我老板是审稿人）
其他理化指标，培养特征，扫描电镜照片作为信息补充也是需要的
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16楼2012-02-17 09:04:20
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wu0519

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
zhang8826857(金币+5): 鼓励交流 2012-02-18 10:15:40
我最近在生工测了几株真菌，快被气晕了，每株菌的结果好多个属，BLAST比对相似率差不多才80%，根本不能用，打电话过去上海生工问，人家理直气壮说你的ＤＮＡ没提好，（我们是直接送的ＤＮＡ，他们负责ＰＣＲ，并ＢＬＡＳＴ，就这些，一株真菌３００）我说DNA没提好，你ＩＴＳ怎么Ｐ出来条带的呀，况且鉴定出来这么多的属，根本白花了钱不能用呀，人家来一句我不管，说让做克隆，一株５１０。我气得都不知道该怎么说，以前读本科的学校是在华大基因测的，人家测不出来准确结果是不收费的，还望楼主慎重考虑，被上当了！！！
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17楼2012-02-17 17:04:10
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丰之第

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by 丰之第 at 2012-02-16 15:37:11:
我以为你要鉴定新种，如果不是鉴定新种的话，直接16srRNA引物PCR扩增，回收，拿去测序，NCBI比对，就知道了。

你是哪里的？要不送到大学实验室去，要别人帮你PCR,测序就可以了。
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18楼2012-02-18 16:39:25
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snowfox0323

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个主要是看你做什么东西了，如果你只是一般的菌株做鉴定的话那只要做分子鉴定就行，还有如果是放线菌的话PCR做16s，不是做ITS的，如果测序后比对是一个新种的话，那有必要做BIOLOG等，为了确定这株菌的分类学地位，一般用于发文章。CICC有资质，他给你鉴定的证书拿到哪人家都承认，就是说你相当于是拿钱买了一张证书，生工只是一般的公司，如果你自己提取DNA，做PCR的话，把片段给他们测序只要30块钱，不过生工测序比较烂。上海有好几家测序的，不行送到华大也比生工好~
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中科院背景，承接生物，能源，化工等各类横向合作，申请课题，申请政府资金cool.323@163.com
19楼2012-03-09 14:48:42
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QQ84508540

捐助贵宾 (小有名气)

强迫症患者

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
391579557: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-03-22 17:15:12
CICC做的是非常全面的鉴定。
而上海生工500元做的是真菌的分子生物学鉴定，400元做细菌分子鉴定，这个价位仅仅测真菌的ITS（18s）区和细菌的16s区的测序，都是保守序列。测序后通过提交到BLAST与其他基因比对，做系统进化树，找到相近的物种，从而确定菌种名称。这种方法比较简便，经济，实用。如果你发现某一新种，或者需要申请专利，或有什么特殊功能，那就要做全序列测定，费用上万。
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★★★★★从☆小☆学☆生☆做☆起！★★★★★
20楼2012-03-15 01:02:33
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