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11楼2012-02-28 15:58:09
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wyq0316

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
这个不难:关于sof和XYZ前面的已经说了,我就不说了在这里。
晶胞中原子的坐标有两种表示方法,一种fractional,一种measured实际上一般都会使用fractional坐标(分数坐标,(0.5,0.5,0.5)表示在晶胞的

中心位置有原子,(0.5,0.5,0)表示在xy面心有原子,一次类推)。
site的地方可以选择坐标的格式。measure一般是原子的实际迪卡尔坐标。相对于原点的。在晶胞建模的时候一般不采用。
attached的意思是当两个原子的距离小于某一值是合为一个原子。
position的解释可能有些麻烦,这个晶体学中说的wickoff position,一般有,按晶胞对称性的差别一般是以a,b,c,d,e,f……表示的,这个表示晶胞中的一些特殊对称位置,比如四面体中心,八面体中心等等。字母前面的数字表示这样的位置在晶胞单胞中的数目,比如4a表示a位置在单胞中有4个。
要想建立一个晶胞需要以下步骤:
1 晶胞的空间群
2 晶胞各原子的坐标
这两个都具备了就可以用dimond模拟晶胞了。
另外还有一个更简单的方法,就是直接获得晶体的cif数据,导入dimond就可以了。cif数据的获取可以在线也可以用软件Findit 2008,网上有下的下载安装就可以。在线的数据库有COD:
http://www.crystallography.net/

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12楼2012-02-28 20:22:38
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