应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » phonon计算负频，声求和规则处理不好
111/2返回列表12下一页
查看: 1394  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

meng303

金虫 (小有名气)

[求助] phonon计算负频，声求和规则处理不好

计算出来有4个虚频，而且数值挺大，
   omega( 1) =     -42.392075 [THz] =   -1414.056821 [cm-1]
     omega( 2) =     -25.911129 [THz] =    -864.307973 [cm-1]
     omega( 3) =     -25.858254 [THz] =    -862.544240 [cm-1]
     omega( 4) =      -2.376714 [THz] =     -79.279188 [cm-1]
之后采用simple，或zero-dim 方式的声求和规则处理，处理结果反而会出现六个虚频，#  mode   [cm-1]     [THz]       IR
    1  -1411.11  -42.3038    0.0000
    2   -862.81  -25.8662    0.0000
    3   -857.35  -25.7025    0.0000
    4    -12.34   -0.3700    0.0000
    5     -6.55   -0.1963    0.0000
    6     -1.32   -0.0397    0.0000
    7      2.64    0.0790    0.0000
    8      4.34    0.1301    0.0000
    9     11.22    0.3365    0.0000
   10     55.15    1.6533    0.0000
是什么原因呢，求助求助，附有输入输出文件
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : ph.in
    • 2012-02-14 15:39:14, 201 bytes
  • 附件 2 : ph.out
    • 2012-02-14 15:39:19, 86.49 K

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-02-14 16:01:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
WDD880227(金币+1): 感谢提示 2012-02-15 08:31:47
meng303(金币+10): 2012-02-15 09:22:49
你这负得太过头了，啥求和规则也不成～如果结构没问题，弛豫很严格，收敛很正确，那就考虑一下赝势是不是有毛病吧～
赞一下 回复此楼
思想重于技巧，内涵重于表象
2楼2012-02-14 22:54:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meng303

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by souledge at 2012-02-14 22:54:39:
你这负得太过头了，啥求和规则也不成～如果结构没问题，弛豫很严格，收敛很正确，那就考虑一下赝势是不是有毛病吧～

计算Gamma点时不是应该设置epsil =true 吗？我设置这一项的话，计算就会报错 from phq_readin : error #         1
     no elec. field with metals
     stopping ...
所以输入文件中我就没有设置，这是不是也是造成频率太负的原因啊，
scf 计算我采用了4 4 1 的Kpoint 以及 ecutwfc =35 Ry  conv_thr =  1.0d-6，这些是不是还不够精确？
赞一下 回复此楼
3楼2012-02-15 09:31:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

贺仪(金币+1): 多谢指教 2012-02-15 22:22:51
贺仪(专家考核): 2012-02-15 22:22:57
引用回帖:
3楼: Originally posted by meng303 at 2012-02-15 09:31:30:
计算Gamma点时不是应该设置epsil =true 吗？我设置这一项的话，计算就会报错 from phq_readin : error #         1
     no elec. field with metals
     stopping ...
所以输入文件中我就没有设置，这是不是 ...

引用回帖:
   Variable:       epsil
   
   Type:           LOGICAL
   Default:        .false.
   Description:    If .true. in a q=0 calculation for a non metal the
                   macroscopic dielectric constant of the system is
                   computed. Do not set epsil to .true. if you have a
                   metallic system or q/=0: the code will complain and stop.

做计算前先仔细看看输入文件的说明～
LZ一没给元素，二没给结构，三没给使用赝势信息，谁也不知道LZ的参数是不是足够～
赞一下 回复此楼
思想重于技巧，内涵重于表象
4楼2012-02-15 10:00:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meng303

金虫 (小有名气)
scf.in见附件，是石墨烯加一个氢原子，这种体系觉得简单一些，试着学习算频率，学习J. Phys. Chem. C 2010, 114, 22636–22643这篇文献
赞一下 回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : scf.in
    • 2012-02-15 10:14:00, 3.52 K
5楼2012-02-15 10:19:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gemucai

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
meng303(金币+10): 2012-02-15 11:00:31
引用回帖:
3楼: Originally posted by meng303 at 2012-02-15 09:31:30:
计算Gamma点时不是应该设置epsil =true 吗？我设置这一项的话，计算就会报错 from phq_readin : error #         1
     no elec. field with metals
     stopping ...
所以输入文件中我就没有设置，这是不是 ...

首先虚频很大的话我怀疑是结构弛豫的问题。

计算Gamma点不一定要设置epsil=true，这是计算介电常数的。试想如果你的体系是金属的话还有没有介电常数可言呢？所以，请检查一下自己的体系是不是金属，或者设置了巡游磁矩，这些都是会报错的。
赞一下 回复此楼
6楼2012-02-15 10:43:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gemucai

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by meng303 at 2012-02-15 10:19:43:
scf.in见附件，是石墨烯加一个氢原子，这种体系觉得简单一些，试着学习算频率，学习J. Phys. Chem. C 2010, 114, 22636–22643这篇文献

石墨烯是金属性的，所以不用设置epsil...
赞一下 回复此楼
7楼2012-02-15 10:47:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gemucai

木虫 (正式写手)
贺仪(金币+1): 多谢指教 2012-02-15 22:23:13
看了输入文件，发现你的设置是tstress = .false.，设置为true试试看压力有多大，太大的话还要进行优化。还有你的结构的对称性变了，我测量的C-C距离都不相等。我想，假如氢原子在苯环中心的话，它对周围6个碳原子的作用都是一样的，所以对称性不会破坏。
赞一下 回复此楼
8楼2012-02-15 10:56:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meng303

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by gemucai at 2012-02-15 10:56:19:
看了输入文件，发现你的设置是tstress = .false.，设置为true试试看压力有多大，太大的话还要进行优化。还有你的结构的对称性变了，我测量的C-C距离都不相等。我想，假如氢原子在苯环中心的话，它对周围6个碳原子 ...

请问，设置tstress = .true计算的压力意义是什么， "太大的话还要进行优化"是收敛标准再高一些吗？
结构优化之后没有对称性No symmetry!是错误的吗?不是不影响计算吗
赞一下 回复此楼
9楼2012-02-15 11:28:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gemucai

木虫 (正式写手)
贺仪(金币+1): 多谢指教 2012-02-15 22:23:27
结构优化不光是使得原子之间受力为0，还要使晶胞与晶胞之间的压力也为0，这就要进行物态拟合，这跟收敛标准没关系。

物态拟合就是保持原有对称性不变而改变晶胞大小，使得总能量有一个最低值，根据能量最低原理这就是最稳定的结构。

其实对称性不好说，但是氢原子与周围最近邻6个碳原子的距离都不等，这就不对了。
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

meng303
10楼2012-02-15 18:57:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 meng303 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 295复试调剂 +7 简木ChuFront 2026-03-19 7/350 2026-03-20 14:11 by 星空星月
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +4 西南交通专材355 2026-03-19 4/200 2026-03-20 11:39 by 花开富贵幸福人�
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +6 困于星晨 2026-03-17 8/400 2026-03-20 11:24 by kkcoco25
[考研] 一志愿吉林大学材料学硕321求调剂 +11 Ymlll 2026-03-18 14/700 2026-03-20 10:46 by EBSD
[论文投稿] 申请回稿延期一个月，编辑同意了。但系统上的时间没变，给编辑又写邮件了，没回复 10+3 wangf9518 2026-03-17 4/200 2026-03-19 23:55 by babero
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-19 5/250 2026-03-19 23:51 by 23Postgrad
[考研] 288求调剂 +15 于海海海海 2026-03-19 15/750 2026-03-19 22:41 by 学员8dgXkO
[考研] 321求调剂 +8 何润采123 2026-03-18 10/500 2026-03-19 16:46 by 何润采123
[考研] 本科郑州大学物理学院，一志愿华科070200学硕，346求调剂 +4 我不是一根葱 2026-03-18 4/200 2026-03-19 09:11 by 浮云166
[考研] 0703化学调剂，求各位老师收留 +10 秋有木北 2026-03-14 10/500 2026-03-19 05:52 by anny19840123
[考研] 328求调剂，英语六级551，有科研经历 +3 生物工程调剂 2026-03-17 7/350 2026-03-18 20:41 by Wangjingyue
[考研] 295求调剂 +3 一志愿京区211 2026-03-18 5/250 2026-03-18 17:03 by zhaoqian0518
[考研] 301求调剂 +9 yy要上岸呀 2026-03-17 9/450 2026-03-18 08:58 by 无际的草原
[考研] 考研化学学硕调剂，一志愿985 +4 张vvvv 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:15 by ruiyingmiao
[考研] 274求调剂 +5 时间点 2026-03-13 5/250 2026-03-17 07:34 by 热情沙漠
[考研] 0854控制工程 359求调剂 可跨专业 +3 626776879 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:42 by 626776879
[考研] 26考研一志愿中国石油大学(华东)305分求调剂 +3 嘉年新程 2026-03-15 3/150 2026-03-15 13:58 by 哈哈哈哈嘿嘿嘿
[考研] 085601材料工程315分求调剂 +3 yang_0104 2026-03-15 3/150 2026-03-15 10:58 by peike
[考研] 本科南京大学一志愿川大药学327 +3 麦田耕者 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:04 by 外星文明
[考研] 289求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-14 6/300 2026-03-14 18:58 by userper
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭