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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » phonon计算负频，声求和规则处理不好
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meng303

金虫 (小有名气)

[求助] phonon计算负频，声求和规则处理不好

计算出来有4个虚频，而且数值挺大，
   omega( 1) =     -42.392075 [THz] =   -1414.056821 [cm-1]
     omega( 2) =     -25.911129 [THz] =    -864.307973 [cm-1]
     omega( 3) =     -25.858254 [THz] =    -862.544240 [cm-1]
     omega( 4) =      -2.376714 [THz] =     -79.279188 [cm-1]
之后采用simple，或zero-dim 方式的声求和规则处理，处理结果反而会出现六个虚频，#  mode   [cm-1]     [THz]       IR
    1  -1411.11  -42.3038    0.0000
    2   -862.81  -25.8662    0.0000
    3   -857.35  -25.7025    0.0000
    4    -12.34   -0.3700    0.0000
    5     -6.55   -0.1963    0.0000
    6     -1.32   -0.0397    0.0000
    7      2.64    0.0790    0.0000
    8      4.34    0.1301    0.0000
    9     11.22    0.3365    0.0000
   10     55.15    1.6533    0.0000
是什么原因呢，求助求助，附有输入输出文件
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    • 2012-02-14 15:39:19, 86.49 K

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1楼 2012-02-14 16:01:58
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
WDD880227(金币+1): 感谢提示 2012-02-15 08:31:47
meng303(金币+10): 2012-02-15 09:22:49
你这负得太过头了，啥求和规则也不成～如果结构没问题，弛豫很严格，收敛很正确，那就考虑一下赝势是不是有毛病吧～
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思想重于技巧，内涵重于表象
2楼2012-02-14 22:54:39
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meng303

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by souledge at 2012-02-14 22:54:39:
你这负得太过头了，啥求和规则也不成～如果结构没问题，弛豫很严格，收敛很正确，那就考虑一下赝势是不是有毛病吧～

计算Gamma点时不是应该设置epsil =true 吗？我设置这一项的话，计算就会报错 from phq_readin : error #         1
     no elec. field with metals
     stopping ...
所以输入文件中我就没有设置，这是不是也是造成频率太负的原因啊，
scf 计算我采用了4 4 1 的Kpoint 以及 ecutwfc =35 Ry  conv_thr =  1.0d-6，这些是不是还不够精确？
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3楼2012-02-15 09:31:30
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

贺仪(金币+1): 多谢指教 2012-02-15 22:22:51
贺仪(专家考核): 2012-02-15 22:22:57
引用回帖:
3楼: Originally posted by meng303 at 2012-02-15 09:31:30:
计算Gamma点时不是应该设置epsil =true 吗？我设置这一项的话，计算就会报错 from phq_readin : error #         1
     no elec. field with metals
     stopping ...
所以输入文件中我就没有设置，这是不是 ...

引用回帖:
   Variable:       epsil
   
   Type:           LOGICAL
   Default:        .false.
   Description:    If .true. in a q=0 calculation for a non metal the
                   macroscopic dielectric constant of the system is
                   computed. Do not set epsil to .true. if you have a
                   metallic system or q/=0: the code will complain and stop.

做计算前先仔细看看输入文件的说明～
LZ一没给元素，二没给结构，三没给使用赝势信息，谁也不知道LZ的参数是不是足够～
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思想重于技巧，内涵重于表象
4楼2012-02-15 10:00:53
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meng303

金虫 (小有名气)
scf.in见附件，是石墨烯加一个氢原子，这种体系觉得简单一些，试着学习算频率，学习J. Phys. Chem. C 2010, 114, 22636–22643这篇文献
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  • 附件 1 : scf.in
    • 2012-02-15 10:14:00, 3.52 K
5楼2012-02-15 10:19:43
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gemucai

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
meng303(金币+10): 2012-02-15 11:00:31
引用回帖:
3楼: Originally posted by meng303 at 2012-02-15 09:31:30:
计算Gamma点时不是应该设置epsil =true 吗？我设置这一项的话，计算就会报错 from phq_readin : error #         1
     no elec. field with metals
     stopping ...
所以输入文件中我就没有设置，这是不是 ...

首先虚频很大的话我怀疑是结构弛豫的问题。

计算Gamma点不一定要设置epsil=true，这是计算介电常数的。试想如果你的体系是金属的话还有没有介电常数可言呢？所以，请检查一下自己的体系是不是金属，或者设置了巡游磁矩，这些都是会报错的。
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6楼2012-02-15 10:43:08
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gemucai

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by meng303 at 2012-02-15 10:19:43:
scf.in见附件，是石墨烯加一个氢原子，这种体系觉得简单一些，试着学习算频率，学习J. Phys. Chem. C 2010, 114, 22636–22643这篇文献

石墨烯是金属性的，所以不用设置epsil...
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7楼2012-02-15 10:47:12
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gemucai

木虫 (正式写手)
贺仪(金币+1): 多谢指教 2012-02-15 22:23:13
看了输入文件，发现你的设置是tstress = .false.，设置为true试试看压力有多大，太大的话还要进行优化。还有你的结构的对称性变了，我测量的C-C距离都不相等。我想，假如氢原子在苯环中心的话，它对周围6个碳原子的作用都是一样的，所以对称性不会破坏。
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8楼2012-02-15 10:56:19
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meng303

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by gemucai at 2012-02-15 10:56:19:
看了输入文件，发现你的设置是tstress = .false.，设置为true试试看压力有多大，太大的话还要进行优化。还有你的结构的对称性变了，我测量的C-C距离都不相等。我想，假如氢原子在苯环中心的话，它对周围6个碳原子 ...

请问，设置tstress = .true计算的压力意义是什么， "太大的话还要进行优化"是收敛标准再高一些吗？
结构优化之后没有对称性No symmetry!是错误的吗?不是不影响计算吗
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9楼2012-02-15 11:28:21
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gemucai

木虫 (正式写手)
贺仪(金币+1): 多谢指教 2012-02-15 22:23:27
结构优化不光是使得原子之间受力为0，还要使晶胞与晶胞之间的压力也为0，这就要进行物态拟合，这跟收敛标准没关系。

物态拟合就是保持原有对称性不变而改变晶胞大小，使得总能量有一个最低值，根据能量最低原理这就是最稳定的结构。

其实对称性不好说，但是氢原子与周围最近邻6个碳原子的距离都不等，这就不对了。
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meng303
10楼2012-02-15 18:57:11
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