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muxiachuixue

木虫 (正式写手)

[求助] 如何计算酶反应过渡态

小弟药物化学专业硕一，现在的课题是计算ugt酶催化黄酮化合物的过渡态，我找了一些文献，越看越蒙啊，现在老板催我让我算起来，但真不知道从何下手，我是个高斯初学者，只会简单的结构优化，过渡态计算只会简单的基元反应，所以问问哪位高手是做酶过渡态方向的？能不能讲讲经验啊，我该从何算起？希望大侠不吝赐教

[ Last edited by 月只蓝 on 2021-9-27 at 09:46 ]
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以无法为有法，以无限为有限
1楼 2012-01-11 13:27:13
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nyzhaoyin

新虫 (正式写手)
计算过度太有不同的方法  其中一种：你可以猜测个过度太的初始结构  然后优化  不就得了
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2楼2012-01-11 13:36:25
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muxiachuixue

木虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by nyzhaoyin at 2012-01-11 13:36:25:
计算过度太有不同的方法  其中一种：你可以猜测个过度太的初始结构  然后优化  不就得了

这倒是可以，但是酶体系设计的问题很多吧
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以无法为有法，以无限为有限
3楼2012-01-13 01:27:45
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xuhu_11

金虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
查查ONIOM,会有帮助的
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千万别考博！
4楼2012-01-13 08:57:22
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肖潇

木虫 (小有名气)
想问一下，此问题解决了吗？
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理论计算
5楼2012-03-20 16:30:29
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muxiachuixue

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 肖潇 at 2012-03-20 16:30:29:
想问一下，此问题解决了吗？

目前正在用oniom方法做，边算边摸索中。。。
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以无法为有法，以无限为有限
6楼2012-03-21 21:19:53
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dragontj

木虫 (正式写手)
我也开始做这方面，感觉很难，无从下手。请问你现在做的怎么样了？
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7楼2012-06-01 23:37:00
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