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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » pbs脚本可否提交新的pbs脚本任务？
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tider

木虫 (正式写手)

[求助] pbs脚本可否提交新的pbs脚本任务？

我假期想在计算机上提交一个比较长的计算任务，因此希望在pbs脚本中实现跳转文件夹目录后自动提交一个新的任务脚本，即：
vi task.pbs
...
cd ../new_task
qsub task2.pbs
...

但是这样提交task.pbs后，task2.pbs并不能被自动提交，请问各位高手有什么办法实现么？
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1楼 2012-01-09 18:14:21
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xh512

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
WDD880227(金币+1): 感谢交流~ 2012-01-10 09:29:20
tider(金币+2): ★有帮助 恩，谢谢交流 2012-01-10 18:13:06
tider(金币+8): ★★★很有帮助 呵呵， 谢谢讨论 2012-01-12 13:05:21
task.pbs
...
mpirun **** /vasp

cd ../new_task
mpirun **** /vasp
****
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2楼2012-01-10 05:32:54
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
WDD880227(金币+1): 感谢分享~~ 2012-01-10 09:29:39
tider(金币+5): ★★★很有帮助 看来也只有这样了，谢谢。只是不知道那种方法实际中是否可以真的实现。 2012-01-10 18:14:44
tider(金币+5): ★★★很有帮助 恩，谢谢你们的讨论 2012-01-12 13:24:52
感觉没有必要这么做，你可以直接把task2.pbs里面的点的任务放在当前的脚本中，按照顺序来就可以了，我都是这么交的
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
3楼2012-01-10 08:28:17
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
vi task.pbs
...
cd ../new_task
qsub task2.pbs
...
想起来了，你这么交不能提交成功的原因在于 qsub task2.pbs是在运行的任务的节点上运行的，而pbs提交任务是在管理节点上的，其他节点不能提交
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
4楼2012-01-10 19:46:46
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xh512

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 贺仪 at 2012-01-10 19:46:46:
vi task.pbs
...
cd ../new_task
qsub task2.pbs
...
想起来了，你这么交不能提交成功的原因在于 qsub task2.pbs是在运行的任务的节点上运行的，而pbs提交任务是在管理节点上的，其他节点不能提交

不一定。别的节点也是能提交的，分情况的，主要看pbs配置了。总之，能不能提交取决于，bash能不能调用qsub，任一节点能不能管理pbs。
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5楼2012-01-11 05:32:27
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by xh512 at 2012-01-11 05:32:27:
不一定。别的节点也是能提交的，分情况的，主要看pbs配置了。总之，能不能提交取决于，bash能不能调用qsub，任一节点能不能管理pbs。

那你设置一下就可以搞定这个问题了，只要在运行任务的节点可以交，你这种嵌套的提交方式也是可以的
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
6楼2012-01-11 08:41:15
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