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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 分子模拟太难了！搞不下去
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veinxuyang

新虫 (小有名气)
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12楼: Originally posted by chaizhm at 2012-01-10 10:27:14:
先把理论看懂了，建立模型的话，刚入手确实挺麻烦的，慢慢会好的

你师兄，几年磨出来的啊？
我看我又没有这个信心
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21楼2012-01-11 10:28:51
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veinxuyang

新虫 (小有名气)
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13楼: Originally posted by hylaqz123 at 2012-01-10 10:48:42:
事在人为，我师兄做模拟的，刚发了一篇大分子

关键是打不好啊。
根本没基础。
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22楼2012-01-11 10:31:12
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veinxuyang

新虫 (小有名气)
在小目虫发过贴。不过都没人回。
就是纤维素模型。建不出。
在ccdc中找到了，导进去也没键连接，瞅着一堆原子，头疼！
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23楼2012-01-11 10:32:39
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veinxuyang

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by nightwalker at 2012-01-09 16:40:43:
具体怎么个情况？什么样的模型？

不知需要坚持几年？
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24楼2012-01-11 10:33:12
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veinxuyang

新虫 (小有名气)
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4楼: Originally posted by yoghurt117 at 2012-01-09 18:37:44:
太难了，别搞了，算啦

我也是。到处找人问，发现你问的那个人还没你知道的多。
基本没人可问。
纳闷，搞分子模拟的人很少么？
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25楼2012-01-11 10:34:17
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veinxuyang

新虫 (小有名气)
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15楼: Originally posted by wangbing2336 at 2012-01-10 11:11:18:
模型要不断核试验结果拟合，否则，常会偏差太大。

我看了一下，大家的专业好像都还贴边。

我这机械的，可咋整。本来对化学啥的，就无基础可言。
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26楼2012-01-11 10:37:12
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whofish

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
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22楼: Originally posted by veinxuyang at 2012-01-11 10:31:12:
关键是打不好啊。
根本没基础。

把MS的功能搞清楚才行啊
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27楼2012-01-11 10:38:04
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whofish

金虫 (小有名气)
引用回帖:
23楼: Originally posted by veinxuyang at 2012-01-11 10:32:39:
在小目虫发过贴。不过都没人回。
就是纤维素模型。建不出。
在ccdc中找到了，导进去也没键连接，瞅着一堆原子，头疼！

建模型是第一步，得有耐心，模型小的话，建议手动输入原子坐标，手动加键。
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28楼2012-01-11 10:39:27
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veinxuyang

新虫 (小有名气)
引用回帖:
26楼: Originally posted by veinxuyang at 2012-01-11 10:37:12:
我看了一下，大家的专业好像都还贴边。

我这机械的，可咋整。本来对化学啥的，就无基础可言。

也是在本版，经介绍，才开始学习MS软件的。

初衷是研究纤维素在某溶液中的反应，晶格变化等性质。。。
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29楼2012-01-11 10:39:32
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veinxuyang

新虫 (小有名气)
引用回帖:
27楼: Originally posted by whofish at 2012-01-11 10:38:04:
把MS的功能搞清楚才行啊

我最初的确是这样做的。
但是文献中的C、H、O只给了coner chain和center chain的一部分。剩下的给了一句：the second residues being generated by a 2-fold screw rotation about axes at(0,0) for corner chain, and (3.901,3.702) for the center chain.
我也理解不上去啊。
看了，问了，说是反演对称。按着将坐标输入了，建出来一看就不对。
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30楼2012-01-11 10:43:06
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