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muxiachuixue

木虫 (正式写手)

[求助] 如何从电子云密度判断反应活性位点?

RT,据说可以通过电子云密度的计算来得知一个化合物的亲核、亲电位点,不知如何操作。论坛里面说用cubegen生成density.cube,但是我用GV显示图形的时候就是一坨啊,无法判断,所以请教高手,我该如何通过计算电子云密度来判断化合物反应的活性位点?以下附上我要研究的化合物结构,研究目的是找出哪一个羟基更容易发生糖苷化反应。
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以无法为有法,以无限为有限
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muxiachuixue

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by chutaoi at 2013-05-30 09:23:25
您好,能发给我这篇文章吗?
Conformational effects, molecular orbitals, and reaction activities of bis(phthalocyaninato) lanthanum double-deckers: Density functional theory calculations

谢谢!ch ...

已发
以无法为有法,以无限为有限
7楼2013-05-30 21:40:57
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990(金币+2): 2012-01-07 17:00:04
muxiachuixue(金币+5): ★★★很有帮助 2012-01-07 20:02:30
谁跟你说通过计算电子云密度来直接判断化合物反应的活性位点的?你去打他一顿吧。
电子云密度确实可以用来判断活性位点,但是你要自己做处理呀。比如通过电子密度差分计算,来得到Fukui函数和Condensed Hardness/Softness。这些都是概念密度泛函的东西。
可以看Phys. Chem. Chem. Phys., 2011, 13, 13277–13286这篇文章的Computational details这部分的第三自然段。
2楼2012-01-07 13:49:03
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muxiachuixue

木虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by yjcmwgk at 2012-01-07 13:49:03:
谁跟你说通过计算电子云密度来直接判断化合物反应的活性位点的?你去打他一顿吧。
电子云密度确实可以用来判断活性位点,但是你要自己做处理呀。比如通过电子密度差分计算,来得到Fukui函数和Condensed ...

斑竹大人,万分感谢,研究研究这篇文章
以无法为有法,以无限为有限
3楼2012-01-07 20:02:23
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yoghurt117

木虫 (正式写手)

谁跟你说通过计算电子云密度来直接判断化合物反应的活性位点的?你去打他一顿吧。


I am 废Man! 把握住每一刻才是最重要的!
4楼2012-01-07 22:26:28
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