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muxiachuixue木虫 (正式写手)
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如何从电子云密度判断反应活性位点？
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RT，据说可以通过电子云密度的计算来得知一个化合物的亲核、亲电位点，不知如何操作。论坛里面说用cubegen生成density.cube，但是我用GV显示图形的时候就是一坨啊 ，无法判断，所以请教高手，我该如何通过计算电子云密度来判断化合物反应的活性位点？以下附上我要研究的化合物结构，研究目的是找出哪一个羟基更容易发生糖苷化反应。 |
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 计算 |
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vigaryang
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5楼2012-01-08 02:39:36
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【答案】应助回帖
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gmy1990(金币+2): 2012-01-07 17:00:04
muxiachuixue(金币+5): ★★★很有帮助 2012-01-07 20:02:30
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gmy1990(金币+2): 2012-01-07 17:00:04
muxiachuixue(金币+5): ★★★很有帮助 2012-01-07 20:02:30
谁跟你说通过计算电子云密度来直接判断化合物反应的活性位点的？你去打他一顿吧。 电子云密度确实可以用来判断活性位点，但是你要自己做处理呀。  比如通过电子密度差分计算，来得到Fukui函数和Condensed Hardness/Softness。这些都是概念密度泛函的东西。可以看Phys. Chem. Chem. Phys., 2011, 13, 13277–13286这篇文章的Computational details这部分的第三自然段。 |
2楼2012-01-07 13:49:03
muxiachuixue
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3楼2012-01-07 20:02:23
yoghurt117
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