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wenj674

金虫 (小有名气)

[交流] 几何优化的对称性约束问题 已有3人参与

各位大侠：
在晶体结构几何优化的时候，把其对称性去掉优化的效果好还是保留原来对称性约束优化的效果好呢？
请各位有经验的大侠不吝赐教啊！！！！
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历史长河一条线，每段重现几百遍。你笑我疯，他说我贱，我都假装看不见。
1楼 2011-12-29 15:34:35
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buct2010

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
fzx2008(金币+1): 谢谢指教 2011-12-30 14:21:59
引用回帖:
3楼: Originally posted by 信任开花 at 2011-12-30 13:08:17:
计算空位型缺陷的时候要先优化一下，步骤：
1. 完美超胞（2*2*2）先优化，取isif=3优化
2. 取上一步骤优化好的原子坐标文件CONTCAR，删除其中一个原子坐标，得到空位型缺陷的初始坐标文件，然后用isif=4优化， ...

晶格常数优化采用ISIF=3
结构弛豫一般用ISIF=2，以保证基矢、倒格矢、布里渊区不变。你说的ISIF=4我没用过，不知道在什么场合适用。因为我关注能带结构，所以这样设置。
对称性是用ISYM来 控制
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4楼2011-12-30 14:20:22
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buct2010

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
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liliangfang(金币+2, 专家考核): 多谢指教 2011-12-30 10:00:34
在计算纯净晶体的时候建议保留对称性，因为纯净晶体是具有空间操作对称性的

掺杂、空位缺陷会改变晶胞对称性，所以计算时应该取消对称性，这样得到的结构更合理
"GaN1−xSbx ... the individual atomic positions have been fully optimized without any symmetry constraints.” 这篇文章计算掺杂时就是这样做的。Visible-light absorption and large band-gap bowing of GaN1−xSbx from first principles PHYSICAL REVIEW B 84, 075304 (2011)
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2楼2011-12-30 09:24:15
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信任开花

铁杆木虫 (知名作家)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
WDD880227(金币+2): 感谢交流~~~有帮助~~ 2011-12-30 15:34:52
引用回帖:
2楼: Originally posted by buct2010 at 2011-12-30 09:24:15:
在计算纯净晶体的时候建议保留对称性，因为纯净晶体是具有空间操作对称性的

掺杂、空位缺陷会改变晶胞对称性，所以计算时应该取消对称性，这样得到的结构更合理
"GaN1−xSbx ... the individual at ...

计算空位型缺陷的时候要先优化一下，步骤：
1. 完美超胞（2*2*2）先优化，取isif=3优化
2. 取上一步骤优化好的原子坐标文件CONTCAR，删除其中一个原子坐标，得到空位型缺陷的初始坐标文件，然后用isif=4优化，以期得到优化驰豫的空位型缺陷的结构

问题是isif优化后OUTCAR文件中的其中一行
external pressure =       -8.69 kB  Pullay stress =        0.00 kB

这个external pressure 有点大，是否是isif选择的问题

可是大家在计算缺陷的时候不是说缺陷的存在不影响晶格参数的大小，这个时候优化应该用isif=4，即固定体积优化么？

还有计算的时候ISYM参数取默认值，是否也要改为ISYM=0

期待专家解答，非常感谢
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从不温柔，从不体贴，从不讲理
3楼2011-12-30 13:08:17
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信任开花

铁杆木虫 (知名作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by buct2010 at 2011-12-30 14:20:22:
晶格常数优化采用ISIF=3
结构弛豫一般用ISIF=2，以保证基矢、倒格矢、布里渊区不变。你说的ISIF=4我没用过，不知道在什么场合适用。因为我关注能带结构，所以这样设置。
对称性是用ISYM来 控制

非常感谢专家的回复

对于二楼你的回帖，是否可以做如下理解：

对于含空位的结构驰豫，ISYM=0才是更符合实际的情况
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从不温柔，从不体贴，从不讲理
5楼2011-12-30 15:05:55
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