| 查看: 376 | 回复: 0 | ||
fwang2011金虫 (小有名气)
|
[求助]
有熟悉cclib method的吗
|
|
系统信息： TOTAL NUMBER OF BASIS SET SHELLS = 937 NUMBER OF CARTESIAN GAUSSIAN BASIS FUNCTIONS = 2343 NUMBER OF ELECTRONS = 1008 CHARGE OF MOLECULE = 0 SPIN MULTIPLICITY = 1 NUMBER OF OCCUPIED ORBITALS (ALPHA) = 504 NUMBER OF OCCUPIED ORBITALS (BETA ) = 504 TOTAL NUMBER OF ATOMS = 340 从Python调用cclib： >>> from cclib.parser import GAMESS >>> from cclib.method import CSPA >>> s=GAMESS("new_b_00.log"  >>> ps=s.parse() [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute atomcoords[] [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute atomnos[] [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute gbasis[] [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute nbasis: 2343 [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute charge: 0 [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute mult: 1 [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute homos[] [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute natom: 340 [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute aooverlaps[] [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute scftargets[] [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute scfvalues[] [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute scfenergies[] [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute moenergies[] [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute mosyms[] [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute nmo: 2343 [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute mocoeffs[] [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute atombasis[] [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute aonames[] [GAMESS new_b_00.log INFO] Creating attribute coreelectrons[] >>> m=CSPA(ps) >>>>>> len(m.fragresults[0]) 2343 >>> len(m.fragresults[0][0]) 204 为何这里的结果不是340 （natom）呢？ 谢谢 有可能帮忙解读一下这个<http://sourceforge.net/apps/medi ... php?title=C_squared>： fragresults: a Numeric array[3] with spin, molecular orbital, and atoms as the axes (atomresults[1][23][4] gives the contribution of the 5th atomic/fragment orbital to the 24th beta molecular orbital) 这里的描述似乎比较乱，请达人解读一下。 Happy New Year everyone! [ Last edited by fwang2011 on 2011-12-27 at 17:38 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
福州大学新能源材料与工程研究院招收2026年入学博士
已经有0人回复
-
海南师范大学2026年博士研究生招收 (在职想提升学历人员可报考) 申请考核制
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有277人回复
-
锂离子电池循环寿命衰减过快，求机理分析与改进思路
已经有2人回复
-
求博导收留
已经有6人回复
-
CSC & MSCA 博洛尼亚大学能源材料课题组博士/博士后招生｜MSCA经费充足、排名优
已经有6人回复
-
德国Karlsruhe Institute of Technology招收电化学储能及联合培养CSC博士等
已经有20人回复
-
德国Karlsruhe Institute of Technology招收电化学储能及联合培养CSC博士
已经有22人回复
-
德国Karlsruhe Institute of Technology招收电化学储能及联合培养CSC博士
已经有1人回复
-
固态锂金属电池迁移数计算求助
已经有1人回复
-
荷兰奈梅亨大学赵文博与Galimberti课题组招收理论计算CSC博士 2000 欧元/月+房补
已经有0人回复
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
质谱的分子峰是自己写的数值决定吗？
已经有9人回复
- 原来上学期间有个参与项目的青椒现在能申请吗
已经有3人回复
- 华中科技大学 博后——待遇怎么样？有熟悉的朋友吗
已经有8人回复
- 【原创】有熟悉加拿大卡里加里大学的虫友吗
已经有8人回复
- 有熟悉绵阳和绵阳九院的朋友吗？
已经有33人回复
- 【求助】有熟悉聚氨酯的吗？
已经有15人回复
- 【求助】对石油开采熟悉的兄弟姐妹,请进！
已经有3人回复
- （转载）食物相克表,请大家熟悉,喜欢可转载
已经有15人回复
- 【交流】生物医学工程有人熟悉吗？
已经有25人回复
- 【请教】大家有熟悉Heck反应的吗？遇到些问题
已经有16人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人