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skh1210

木虫 (小有名气)

[求助] 结合能计算

用高斯进行分子模拟,计算体系结合能时,结合能=总体系的能量-子体系的能量。请问其中的子体系的能量是指将子体系单独优化之后得到的能量,还是从总体系优化结构中取出的子体系的能量?
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倚天舰

木虫 (小有名气)

★ ★
chaizhm(金币+2): 谢谢~ 2011-12-24 19:55:27
我做的时候是第二种算法
2楼2011-12-24 09:41:33
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skh1210

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 倚天舰 at 2011-12-24 09:41:33:
我做的时候是第二种算法

第二种算法是指从优化出的总体系中取出的子体系的能量吗?请问你这样做有依据吗,或者有相关的文献参考吗?
3楼2011-12-24 15:54:06
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倚天舰

木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
chaizhm(金币+3): 谢谢~ 2011-12-24 19:55:45
jiaoyixiong(金币+5): 鼓励交流 2011-12-25 22:53:58
引用回帖:
3楼: Originally posted by skh1210 at 2011-12-24 15:54:06:
第二种算法是指从优化出的总体系中取出的子体系的能量吗?请问你这样做有依据吗,或者有相关的文献参考吗?

《Materials Studio培训教程》里聚合物与金属氧化物表面的相互作用这个例子就是这么做的

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  • 2011-12-24 17:57:59, 4.25 M

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4楼2011-12-24 17:58:17
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skh1210

木虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by 倚天舰 at 2011-12-24 17:58:17:
《Materials Studio培训教程》里聚合物与金属氧化物表面的相互作用这个例子就是这么做的

谢谢啊!
5楼2011-12-24 18:39:09
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wisdom182

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
skh1210(金币+2): 有帮助 2012-01-06 18:23:33
我觉得是总能量减去各自优化的能量吧。如果需要更精确的相互作用能,需要进行BSSE校正。
6楼2012-01-05 13:13:09
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lqzdonald

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
skh1210(金币+3): 有帮助 2012-01-06 18:21:21
skh1210(金币+3): 有帮助 2012-01-06 18:22:20
这两种都可以,一般用第一种方法,不过如果作用很大,单体在复合体中都变形了,就得用第二种。另外在多体分解时就是采用第二种方法。
7楼2012-01-05 22:17:25
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skh1210

木虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by lqzdonald at 2012-01-05 22:17:25:
这两种都可以,一般用第一种方法,不过如果作用很大,单体在复合体中都变形了,就得用第二种。另外在多体分解时就是采用第二种方法。

我看有的人总结的说必须用第一种方法,我分别用这两种方法算出来的结果相差很大。你这种说法有依据吗?
8楼2012-01-11 11:54:22
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