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xubolucky金虫 (小有名气)
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求助：关于质谱与蛋白质三级结构的问题！
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各位虫友们，我想请教一下：使用质谱能够测定蛋白质三级结构吗？如果能，用什么技术测定？如果不能，是否能够对已知的蛋白质三级结构进行检验？或者说是能不能用质谱进行粗略的三级结构测定？ 请指教，谢谢！ |
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brightfuture01
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【答案】应助回帖
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amisking(金币+4, BioEPI+1): 鼓励积极应助！ 2011-12-17 19:50:48
xubolucky(金币+7): 2011-12-17 21:16:02
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xubolucky(金币+7): 2011-12-17 21:16:02
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如果单纯的质谱也就是能测定蛋白质的分子量，但是这项技术如果和其他一些技术合并，功能能多一些。如果整合了特定的酶切，对肽段进行鉴定，就成为肽指纹图谱，可以和数据库比对，确定是什么蛋白；如果是把氨基酸一个一个剥离下来再用质谱，就能对蛋白进行氨基酸测序…… 质谱和三维结构根本就没有关系。三维结构的测定方法目前最常用最为经典的是X-射线衍射法，现在也有电镜的。对于分子量在30KD一下的，也有NMR的。但是不管是那一种方法可能都是面临着重重困难。 不过结构生物学发展到今天已经在PDB数据库中提交了大量的蛋白，如果蛋白并不特殊，多多少少都能在这个数据库中找到一定同源性的蛋白。如果氨基酸的同源度大于40%，呵呵，他们的空间结构一般就不会有很大差别了。 |
4楼2011-12-17 17:52:45
xubolucky
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