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furoc

木虫 (小有名气)

[求助] 求助gaussian计算的ECD如何作图

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刚用gaussian09计算了一个化合物的ECD得到了波长和相应的Rotatory Strengths,现在苦恼不知该如何用origin作图。还请高手指点。不胜感激!
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009(金币+5): 2011-12-16 09:16:28
furoc(金币+5): 2011-12-16 09:41:54
先用rotatory strength做正态分布展宽,得到拟合的连续曲线,然后用origin作图即可
展宽公式可以看这篇文章J Phys Chem A,2011,115,13811,Computational Details这个部分中的Electronic Absorption Spectrum中的公式,公式中的fI的取值换成ECD计算中的rotatory strength即可(原先公式中的fI是紫外-可见跃迁计算中的oscillator strength)
其实swizard这个软件做得挺好,就是只能做紫外-可见跃迁光谱展宽,不能做ECD光谱展宽。你就委屈一下自己写程序做展宽吧。
2楼2011-12-16 08:32:15
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furoc

木虫 (小有名气)

版主,由于我不是计算专业的,对正态分布展宽还是不太明白,公式的计算是需要什么软件来做呢?还望指点。
3楼2011-12-16 10:54:13
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furoc

木虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by yjcmwgk at 2011-12-16 08:32:15:
先用rotatory strength做正态分布展宽,得到拟合的连续曲线,然后用origin作图即可
展宽公式可以看这篇文章J Phys Chem A,2011,115,13811,Computational Details这个部分中的Electronic Absorption Spectrum中的 ...

版主,由于我不是计算专业的,对正态分布展宽还是不太明白,公式的计算是需要什么软件来做呢?还望指点。
4楼2011-12-16 10:54:34
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

引用回帖:
4楼: Originally posted by furoc at 2011-12-16 10:54:34:
版主,由于我不是计算专业的,对正态分布展宽还是不太明白,公式的计算是需要什么软件来做呢?还望指点。

那就随意找一个计算专业的人 帮你写个小程序呗 这容易得很甚至不需要理论计算化学专业,只要是搞计算机的都行 会写程序的就行
5楼2011-12-16 12:40:54
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furoc

木虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by yjcmwgk at 2011-12-16 12:40:54:
那就随意找一个计算专业的人 帮你写个小程序呗 这容易得很甚至不需要理论计算化学专业,只要是搞计算机的都行 会写程序的就行

唉。我对程序找个东西是一窍不通啊,还有一个问题就是,文献公式中ω代表什么意思啊?
6楼2011-12-16 13:48:54
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

★ ★ ★
zhou2009(金币+3): 2011-12-16 19:54:30
引用回帖:
6楼: Originally posted by furoc at 2011-12-16 13:48:54:
唉。我对程序找个东西是一窍不通啊,还有一个问题就是,文献公式中ω代表什么意思啊?

唉,算了,我的邮箱qdd-china@foxmail.com
你把实验数值和计算结果输出文件发给我吧。我替你处理下算了……反正我讲解,你听得也费劲;你找人,估计找人也费劲
7楼2011-12-16 14:07:58
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furoc

木虫 (小有名气)


版主,您好!数据已发您邮箱,另外,我还有一个问题,我在一篇文献上看到如图的一个公式,但是不知道公式里的E和σ是怎么得到的,还请指教。
8楼2011-12-16 16:02:21
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furoc

木虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by yjcmwgk at 2011-12-16 14:07:58:
唉,算了,我的邮箱qdd-china@foxmail.com
你把实验数值和计算结果输出文件发给我吧。我替你处理下算了……反正我讲解,你听得也费劲;你找人,估计找人也费劲

非常感谢。
9楼2011-12-16 16:03:36
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