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关于序列比对算法 的一小段翻译,尽量精确,金币多多~
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| 对于相似的同源DNA 序列,本文方法指定第一条序列作为中心星序列。依次将该序列与其他序列做比对,记录下每次中心星序列插入空格的位置,这些可以写入文件保存,以节省内存消耗。设第一条序列长为m,则在这m个字符中间及前后共有m+1 个位置可以插入空隙,当比对之后,综合第一条序列与每条序列比对时插入的空格,记录每个空隙在比对过程中最多插入的空格数。于是m个碱基和m+1 个空隙组成了第一条序列(中心星序列)的最终比对结果。得到了比对后的中心星序列,再依次将各个序列与该序列比对,便得到了最终比对结果。值得注意的是,中心星序列综合入所有插入的空格后,一定比所有其他序列都长,最后的比对不允许向中心星序列插入空格,对应于图1 的动态规划表就是只允许向前或向左上回溯,不可以向上回溯。 |
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