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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 请教一下，跑完NPT 50ps再跑NVT 时，需要用“use restart data”这一项吗？
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pinkrose

金虫 (小有名气)

[求助] 请教一下，跑完NPT 50ps再跑NVT 时，需要用“use restart data”这一项吗？

小弟新手，谢谢！
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1楼 2011-12-14 22:06:52
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fhxy123

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
楼主是怎么做的，我也用到系综的转化，先NVT在NPT,不知道该怎么做？
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2楼2011-12-15 09:30:10
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pinkrose

金虫 (小有名气)
★ ★
chaizhm(金币+2): 谢谢交流~ 2011-12-15 16:02:23
引用回帖:
楼: Originally posted by fhxy123 at 2011-12-15 09:30:10:
楼主是怎么做的，我也用到系综的转化，先NVT在NPT,不知道该怎么做？

貌似两个系统的分析是不能用重启功能的....
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3楼2011-12-15 10:10:39
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qianglinhui

铜虫 (小有名气)
请教楼主为什么要这样做呢？
我现在也是用两个系综再算，先跑nvt 再npt我就直接这么算的 也不知道对不对啊
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现实可以战胜一切
4楼2011-12-15 10:56:29
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061302102

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
请问楼主，NPT系综中的参数是如何设置的？
我也想试试，曾经试过，可是不知道为什么算不出来
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5楼2011-12-15 14:26:53
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pinkrose

金虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by 061302102 at 2011-12-15 14:26:53:
请问楼主，NPT系综中的参数是如何设置的？
我也想试试，曾经试过，可是不知道为什么算不出来

我也正在算，算了几次都不对
赞一下 回复此楼
6楼2011-12-16 09:44:14
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pinkrose

金虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by qianglinhui at 2011-12-15 10:56:29:
请教楼主为什么要这样做呢？
我现在也是用两个系综再算，先跑nvt 再npt我就直接这么算的 也不知道对不对啊

我也不晓得对不对
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7楼2011-12-16 09:44:45
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sikasun

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-12-16 21:37:43
用你之前跑的最终的构象，跑下一个系综就可以了
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8楼2011-12-16 10:00:19
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mimizong

新虫 (小有名气)
我做个NVT或者NPT  50ps 都要八九个小时，似乎不用选你说的那个选项
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9楼2012-02-11 10:35:46
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upc穆宁

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by sikasun at 2011-12-16 10:00:19
用你之前跑的最终的构象，跑下一个系综就可以了

动力学模拟设置时，可以选择是否勾选use restart data。这个选项到底是什么意思呢，跑下一个动力学的时候是从上一个跑的最后构象开始模拟？那和打开上一个模拟的最后一个构象，不勾选这个对话框，直接开始模拟，有区别吗？
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10楼2013-05-20 11:13:10
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