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bubuweiying

金虫 (著名写手)

[求助] 官能团电荷

高斯中官能团的电荷是指官能团中各原子电荷(Mulliken charges)的相加么,如COOH的电荷是指C,O,O,H四个原子电荷的总和么,谢谢啊
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★ ★ ★ ★
zhou2009(金币+5): 2011-12-13 17:30:44
官能团的电荷可以通过原子电荷相加来计算,然而计算原子电荷方法多种多样(可参见此文http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml),因此计算官能团电荷的方法也多种多样,没有唯一的定义。而在一些力场里,比如gromos力场中,COOH基团的电荷则被精确定义为0。

定义官能团绝对的电荷值任意性很大。而正如zhou2009所说,横向比较不同化合物中相同官能团的电荷变化趋势可以很大程度上掩盖住不同电荷模型定义间的任意性,在物理和实际意义上也更明确。

也有不通过原子电荷加和方法来获取官能团电荷的做法。直接积分官能团空间内的密度差是一种,另一种是给不同基团定义基团电负性,然后通过电负性均衡原理来获得不同化学环境中的官能团电荷。
5楼2011-12-13 13:51:48
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静水四叶草

金虫 (小有名气)

小笨蛋精灵

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果你用的高斯计算,最后会有一个总的电荷。你看那个数据就行了。
开心求知每一天!
2楼2011-12-13 09:16:25
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luolun2008

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
bubuweiying(金币+5): 2011-12-13 14:44:08
我认为可以这么相加,但mulliken电荷不是太准确啊。你可以看看这个帖子,可能对你有帮助。http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2456809
尘埃落定之前,一切皆有可能!!!
3楼2011-12-13 09:29:26
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
bubuweiying(金币+5): 2011-12-13 14:45:47
高斯中官能团的电荷可以是指官能团中各原子电荷(Mulliken charges)的相加。
但这还是比较粗略,因为Mulliken charges有些缺点。

对如-COOH的电荷,是C,O,O,H四个原子净电荷的总和。
它还是可以体现出-COOH拉过来一些电荷,并且在-COOH分配了。
在有机化学同系物中比较时,Mulliken charges的误差还可以作为系统误差有所抵消。

这种电荷虽然不够精确,但还不是经验理论的“形式电荷”。

但是我想如果做R-COOH与-R和-COOH的电子密度差,可能-COOH上拉过来的电荷会比较准确。Gsgrid会自动计算-COOH空间拉过来的电荷,避免Mulliken charges的缺点。

[ Last edited by zhou2009 on 2011-12-13 at 10:53 ]
4楼2011-12-13 10:38:19
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