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siesta 计算电子占据数的问题
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我用siesta计算石墨烯纳米带的H和C原子的占据数发现，用SZ基组算出来的和用DZP计算出来的结果有很大的区别，DZP计算的结果很不合理。接着我用水分子做了一下测试，结果如下： SZ:Species: H Atom Qatom Qorb 1s 1 0.840 0.840 2 0.840 0.840 3 0.840 0.840 4 0.840 0.840 Species: C Atom Qatom Qorb 2s 2py 2pz 2px 5 4.639 1.216 1.141 1.141 1.141 DZP： Atom Qatom Qorb 1s 1s 1Ppy 1Ppz 1Ppx 1 1.203 0.831 0.272 0.034 0.033 0.033 2 1.203 0.831 0.272 0.033 0.034 0.033 3 1.204 0.833 0.271 0.033 0.033 0.033 4 1.204 0.833 0.271 0.033 0.033 0.034 2s 2s 2py 2pz 2px 2py 2pz 2px 2Pdxy 2Pdyz 2Pdz2 2Pdxz 2Pdx2-y2 5 3.187 -0.047 0.750 0.194 0.194 0.192 0.622 0.622 0.622 0.004 0.008 0.009 0.004 0.011 很明显DZP 的结果不对，是不是siesta程序本身的原因？ |
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3楼2011-12-09 14:31:06
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我的甲烷的input文件为： SystemName ch4 SystemLabel Ch4 NumberOfAtoms 5 NumberOfSpecies 2 MeshCutoff 50 Ry %block ChemicalSpeciesLabel 1 1 H # Species index, atomic number, species label 2 6 C %endblock ChemicalSpeciesLabel PAO.BasisSize DZP XC.functional GGA XC.authors PBE WriteMullikenPop 1 AtomicCoordinatesFormat Ang %block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies -0.380000123 -1.038179245 0.278179290 1 -0.379999607 0.278179338 -1.038179422 1 -0.379999607 0.760000084 0.760000084 1 1.139999981 0.000000000 0.000000000 1 0.000000000 0.000000000 0.000000000 2 %endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies save-rho T save-delta-rho T save-total-potential T save-neutral-atom-potential T save-hs T |
2楼2011-12-08 10:25:25
zhangguangping
木虫 (著名写手)
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冻冻2007: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-05-04 15:52:07
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首先，需要声明的是对于采用原子轨道基组计算，随着基组增大，计算结果并不一定要更好，但是趋势是好的，这一点和平面波基组是不同的。 第二，关于你的计算的问题。存在至少两个疑问。一个是你的MeshCutoff 50 Ry我认为是小的，建议使用150Ry甚至200Ry。另外，一个问题是你的基组的问题，建议加入这个选项：PAO.EnergyShift 100 meV，并且使用我的这个值，默认是272 meV。 估计这两个选项可以改善你的问题。 再有就是你的赝势的问题。可以最后考虑它的因素。你先用官方网站上的赝势计算试试。 |
4楼2012-02-28 15:03:10
