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求助mol格式的软件
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alwens
铁杆木虫 (正式写手)
老木虫
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- 在线: 805.8小时
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- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
2楼2007-01-15 16:38:47
3楼2007-01-15 16:46:56
alwens
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cordiela(金币+1):感谢参与应助，欢迎常来！
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windows下就用chemoffice（chemdraw）好了，可读可存，作化学的经常用。小木虫里有绿色版的chemdraw，你可以试试。 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=253660&fpage=1 [ Last edited by alwens on 2007-1-15 at 16:58 ] |
4楼2007-01-15 16:54:15
5楼2007-01-15 16:59:18
Open Babel
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cordiela(金币+1):感谢参与应助，欢迎常来！
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下载地址:http://www.quantumchemistry.net/Programs/O/200601/179.html 支持大量的常见化学文件格式.支持的输入类型有：alc (Alchemy文件)，prep (Amber PREP文件)，bs (Ball & Stick文件)，caccrt (Cacao直角坐标文件)，ccc (CCC文件)，c3d1 (Chem3D直角坐标1文件)，c3d2 (Chem3D直角坐标2文件)，cml (Chemical Markup Language文件)，crk2d (CRK2D文件)，crk3d (CRK3D文件)，box (Dock 3.5 Box文件)，dmol (DMol3直角坐标文件)，feat (Feature文件)，gam (GAMESS输出文件)，gamout (GAMESS输出文件)，gpr (Ghemical工程文件)，mm1gp (Ghemical MM文件)，qm1gp (Ghemical QM文件)，hin (HyperChem HIN文件)，jout (Jaguar输出文件)，mmd (MacroModel文件)，mmod (MacroModel文件)，out (MacroModel文件)，dat (MacroModel文件)，car (MSI Biosym/Insight II CAR文件)，sdf (MDL Isis SDF文件)，sd (MDL Isis SDF文件)，mdl (MDL Molfile文件)，mol (MDL Molfile 文件)，mopcrt (MOPAC直角坐标文件)，mopout (MOPAC输出文件)，mmads (MMADS文件)，mpqc (MPQC文件)，bgf (MSI BGF文件)，nwo (NWChem输出文件)，pdb (PDB文件)，ent (PDB文件)，pqs (PQS文件)，qcout (Q-Chem输出文件)，res (ShelX文件)，ins (ShelX文件)，smi (SMILES文件)，mol2 (Sybyl Mol2文件)，unixyz (UniChem XYZ文件)，vmol (ViewMol文件)，xyz (XYZ文件)。支持的输出类型有：alc (Alchemy文件)，bs (Ball & Stick文件)，caccrt (Cacao直角坐标文件)，cacint (Cacao内坐标文件)，cache (CAChe MolStruct文件)，c3d1 (Chem3D直角坐标1文件)，c3d2 (Chem3D直角坐标2文件)，ct (ChemDraw连接关系表文件)，cht (Chemtool文件)，cml (Chemical Markup Language文件)，crk2d (CRK2D文件)，crk3d (CRK3D文件)，cssr (CSD CSSR文件)，box (Dock 3.5 Box文件)，dmol (DMol3文件)，feat (Feature文件)，fh (Fenske-Hall Z-Matrix文件)，gamin (GAMESS输入文件)，inp (GAMESS输入文件)，gcart (Gaussian直角坐标文件)，gau (Gaussian输入文件)，gpr (Ghemical工程文件)，gr96a (GROMOS96 (A)文件)，gr96n (GROMOS96 (nm)文件)，hin (HyperChem HIN文件)，jin (Jaguar输入文件)，bin (OpenEye二进制文件)，mmd (MacroModel文件)，mmod (MacroModel文件)，out (MacroModel文件)，dat (MacroModel文件)，sdf (MDL Isis SDF文件)，sd (MDL Isis SDF文件)，mdl (MDL Molfile文件)，mol (MDL Molfile文件)，mopcrt (MOPAC直角坐标文件)，mmads (MMADS文件)，bgf (MSI BGF文件)，csr (MSI Quanta CSR文件)，nw (NWChem输入文件)，pdb (PDB文件)，ent (PDB文件)，pov (POV-Ray输出文件)，pqs (PQS文件)，report (Report文件)，qcin (Q-Chem输入文件)，smi (SMILES文件)，fix (SMILES Fix文件)，mol2 (Sybyl Mol2文件)，txyz (Tinker XYZ文件)，txt (Titles文件)，unixyz (UniChem XYZ文件)，vmol (ViewMol文件)，xed (XED文件)，xyz (XYZ文件)，zin (ZINDO输入文件)。文件类型基于扩展名。 支持化学MIME。 SMARTS匹配器。 柔性原子打印。 柔性键打印。 部分电荷计算。 添加或删除氢。 支持同位素，进行平均计算。 自动猜测环，键，杂化，芳香性。 多构象分子存储。 命令行转换一个文件中的多个分子。 命令行界面。 二进制矢量类。 矢量与矩阵的转换。 分子测试组。 [ Last edited by chemicalsub on 2007-1-15 at 17:09 ] |
6楼2007-01-15 17:05:11
7楼2007-01-15 17:20:03
8楼2007-01-15 18:26:38
wjmed
木虫 (正式写手)
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- 专业: 化学生物学与生物有机化学
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小骆(金币+3):谢谢,能教我怎么看mol文件吗?我看不懂.
cordiela(金币+1):感谢参与应助，欢迎常来！
小骆(金币+3):谢谢,能教我怎么看mol文件吗?我看不懂.
cordiela(金币+1):感谢参与应助，欢迎常来！
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用mdl公司开发的isis draw就可以构建 而且这个软件是免费的，从这里下载 http://www.dhere.com/soft/soft.asp?SOFTID=32873 [ Last edited by wjmed on 2007-1-15 at 20:13 ] |
9楼2007-01-15 20:11:48
10楼2007-01-15 21:13:47