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2007年1月11日的《自然要览》
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[自然要览] （选自英国Nature杂志，2007年1月11日出版） 封面故事：反映大脑中基因表达情况的图集 Genome-wide atlas of gene expression in the adult mouse brain 研究人员在神经科学和遗传学两个学科都已经进入了一个新的前沿领域。小鼠基 因组中大约22000个基因中每个基因的表达，都已经在小鼠大脑所有主要结构上 以细胞分辨率被测绘出来。这一成就是“艾伦脑科学研究所”“脑图集” （Brain Atlas）项目的一部分。Lein等人介绍了该图集的形成过程（这个图集 发布在 http://www.brain-map.org/上，读者可以免费查看），并且报告了既支 持现有脑解剖观点、又挑战现有脑解剖观点的基因表达模式。该图集包括原位图 像和按色度比做成的每个基因和每个大脑区域的信号强度的“热图”（heat maps）。尽管有预测说大脑只能表达有限数量的基因，但小鼠全部基因的大约 80%已经表达出来；其中70%的基因信号局限在数量不到全部脑细胞20%的脑细胞 上，说明大部分基因信号局限于大脑中很小的区域。（Article p. 168; News & Views）封面图片：Chris Lau（艾伦脑科学研究所）。 决定海洋中固氮作用的主要因素（Fixing a hole） Spatial coupling of nitrogen inputs and losses in the ocean 固氮是维持海洋中生物生产力的关键，因为它能代替通过脱氮作用（在脱氮过程 中，亚硝酸盐和硝酸盐被转化成氮气）而损失的生物可以利用的氮。控制这一过 程的因素仍然不确定，但人们普遍所持的一个观点是，向固氮菌供应铁的速率是 限速的。解决这一问题的一个新方法（该方法根据一个海洋环流模型中的养分分 布来推断固氮速率）得出一个让人吃惊的发现：固氮速率在太平洋中最高（在太 平洋中，来自大气的铁供应低，脱氮速率高），在大西洋中最低（在大西洋中， 铁的供应更丰富）。这说明，海洋中的固氮不是取决于铁的水平，而是受脱氮作 用的刺激，后者有助于稳定海洋中被固定的氮的存量。（Article p. 163; News & Views） 受损心脏的修复（Repair of the heart） Thymosin 4 induces adult epicardial progenitor mobilization and neovascularization Thymosin ?4是一种已知能够减少心脏病之后肌肉细胞损失的蛋白，研究人员曾 发现它能指导心脏来将自身治愈。心脏最外层中的祖先细胞，可在thymosin ?4 的引导下向里面运动，帮助修复成年实验鼠的有问题的心脏。以前科学家认为， 成年心脏中的细胞处于一种永久性的静止状态，任何能帮助心脏组织修复的祖先 细胞都来自骨髓。Thymosin ?4诱发的血管形成和营养作用，也许能比现有方法 更好地修复受损的成年心脏。（Article p. 177） 恒星的碰撞与黑洞的形成（A hole in one） A black hole in a globular cluster 理论预测，堆积成球状星团的数千颗古老恒星中其中一些之间的碰撞，应能导致 巨大黑洞的形成。以前未曾观测到这样的黑洞，所以是不是说另一个理论、即认 为恒星之间的碰撞会将大多数或全部黑洞从星团中排斥出来的理论会是正确的？ 在与室女座中巨大椭圆形星系NGC 4472相关的一个球状星团中的一个正在生长中 的黑洞的X-射线特征谱线的发现，为这个问题提供了部分答案。它只不过是数千 个球状星团中其中一个中的一个黑洞而已，但通过研究其性质，应有可能判断是 否存在处于类似条件下的其他黑洞。（Letter p. 183） 合成陶瓷稳定核废料耐久性很差（Ceramics under fire） Quantification of actinide -radiation damage in minerals and ceramics 关于用地质方法处置核废料的大部分建议都涉及将钚和其他錒系元素分离开，以 给予特别关注。它们是阿尔法射线的强大发射体，将其固定在陶瓷中而非玻璃中 是优先选择的处理方法。自然生成的锆石在固定同位素方面耐久性非常好，它们 能将铀和钍同位素固定几十亿年时间。受自然生成的锆石的启发，有人认为一组 合成的陶瓷也能起这种作用。对合成的锆石在固定富含钚的材料方面的能力所做 的一项新的研究表明，合成材料并没有人们以前所想的那么耐久。 这些同位素 发射出的阿尔法粒子能将陶瓷中的原子敲击离位，使陶瓷材料更容易破碎。该现 象比以前所估计的更明显：在实践中这意味着，在放射性同位素储存仅仅1400年 之后射线就可能会泄漏出来，远远短于241000年这样一个目标稳定时间。积极的 一面是，这项工作为定量评估稳定錒系元素所急需的、耐久性可能会更好的其他 结构提供了一个方法。（Letter p. 190; News & Views） 火山气体组成未必能反映岩浆状态（Volcanic gases can mislead） Redox evolution of a degassing magma rising to the surface 火山气体的组成可被地质学家用来监测火山活动，或用作反映大气组成是怎样随 时间变化的指示器。科学家隐含地假设，这些气体能够忠实地反映其所来自的岩 浆的状态，尤其是氧化-还原状态。但对火山气体排放过程所做的详细的物理-化 学模拟显示，这一假设一般并不是正确的，氧化-还原状态或所喷发的岩浆未必 能反映排放到大气层中的气体的氧化-还原状态。这一发现可能要求我们对旨在 量化地质过程中岩浆挥发物所起作用的模型重新给予审视。（Letter p. 194） 陡山沱微化石到底是什么？（They might be giants） Evidence of giant sulphur bacteria in Neoproterozoic phosphorites 来自中国新元古代陡山沱组的球状微化石，可以说是过去10年间最重要的化石发 现之一。过去，它们曾被认为是动物胚胎，研究人员是根据它们的大小及还原性 细胞分裂的存在做出这种判断的。如果这种认识是正确的，那么距今6亿年的已 成化石的细胞，就能够为了解早期动物演化提供一个重要窗口。但如果它们当中 很多根本不是胚胎怎么办？最近在现代硫细菌Thiomargarita中还原性细胞分裂 及其与磷酸盐矿化沉积的直接联系的发现，使得研究人员找到了与很多常见的陡 山沱微化石在大小和结构上都相似的东西。动物胚胎的这种积累总是被认为是有 问题的，因为缺乏可信的磷化机制。因此，对这些化石的最简单的解释是，它们 是巨型的硫细菌。（Letter p. 198; News & Views） 人类环境的改变对食物链中物种关系的影响（A tangled web） Habitat modification alters the structure of tropical host–parasitoid food webs 全球变化有可能影响物种相互作用，但这种影响对生态系统功能和稳定性的后果 却难以预测。量化的食物链为探索这种问题提供了强大的工具，但到目前为止它 们一直被用来描述单个的生物群落。对厄瓜多尔Choco-Manabi地区（那里大规模 农业生产威胁到了当地的生物多样性）的48个地块所做的一项研究表明，人类生 活环境的改变，能够急剧影响宿主-拟寄生体食物链中物种之间的进食关系网 络。从热带雨林向集约农业的转变，对蜜蜂和黄蜂造成了消极的后果，这两类蜂 都是授粉和生物虫害控制的重要生物。（Letter p. 202） 脊椎动物与触觉相关的分子（TOUCH BASE） A stomatin-domain protein essential for touch sensation in the mouse 触觉是由皮肤中的很多机械受体调控的。现在，研究人员首次在一种脊椎动物身 上发现了一种分子，该分子的功能是这一初级传导活动所必需的。在活体试验 中，膜蛋白SLP3（stomatin-like protein 3）是小鼠的机械受体功能所必需 的，也是机械传感通道发挥功能所必需的。SLP3还调控以前被发现与触觉相关的 离子通道，所以它可能是哺乳动物触觉传感器的一个亚单元。（Letter p. 206） 三种海洋黄杆菌被发现含有proteorhodopsin基因（Proterorhodopsin goes large） Light stimulates growth of proteorhodopsin-containing marine Flavobacteria 6年前细菌proteorhodopsin基因在海洋中的发现预示着，表面海水中存在着一种 以前不知道的、从阳光生成能量的形式。此后，为proteorhodopsin编码的基因 序列被发现广泛分布在世界上的海洋里，但在培养中含有proteorhodopsin的细 菌分离菌种的缺乏，妨碍了对这一新的光营养形式的功能研究。现在，在全面的 基因组分析之后，proteorhodopsin基因已经在三种海洋黄杆菌 （Flavobacteria）中被发现。生长实验显示，当这些细菌中其中一种在光下生 长时，细胞产率就会增加。黄杆菌是海洋浮游细菌的一个重要组成成分，而 proteorhodopsin似乎是海洋能量平衡体系中的一个重要成员。（Letter p. 210） 在只有4个细胞的胚胎阶段细胞就开始分异了（Early developers） Histone arginine methylation regulates pluripotency in the early mouse embryo 认为哺乳动物胚胎细胞在形成“里面的”细胞和“外面的”细胞之前都是一样的 假设，被最近的一项发现推翻了，该发现是，从仅有4个细胞的早期阶段开始， 小鼠的细胞在细胞命运上就有所不同了。当时研究人员认为可能存在一种外成机 制（即非DNA编码的机制），而现在事实证明的确是这样。在只有4个细胞的小鼠 分裂球中的组蛋白H3的差异性外成修饰（某些精氨酸的甲基化）改变了胚胎细胞 的命运，并且能将一个细胞保持在一种多能状态。（Letter p. 214） |
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