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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 大家帮忙看看VMD安装过程中出现的问题！~
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zhangliang8

木虫 (正式写手)

木虫之友

[求助] 大家帮忙看看VMD安装过程中出现的问题！~

本人刚开始接触LAMMPS软件，在安装VMD过程中始终出现问题，望各位大侠帮忙给点建议：

首先，我的configure文件如下：
$install_name="vmd"
$install_bin_dir="/usr/local/vmd/bin"
$install_library_dir="/usr/local/vmd/lib/$install_name"

这里的路径需要修改吗，修改的原则是什么呢？我是按照默认的路径。。。

然后，按照大家的做法，在终端vmd文件夹的路径下输入 ./configure
cd src
sudo make install

得到如下信息：
Info: /bin/csh shell not found, installing Bourne shell starup script instead.
Make sure  /usr/local/vmd/bin/vmd is in your path.
VMD installation complete. Enjoy!

虽然最后显示安装完成，但明显速度太快，不像安装成功的样子。到底是有相关的package没有安装，还是上面configure的路径有问题呢？？

需要大家给点指导！谢谢了
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1楼 2011-11-26 19:28:11
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usoado

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-11-28 12:04:23
zhangliang8(金币+2): 谢谢关注！ 2011-11-29 18:42:05
jiaoyixiong(金币+2): 鼓励交流 2011-12-11 22:51:28
我从网站上下载的VMD，放在了后面/home/myname 的主目录里面。直接输入后就OK了，没有地方需要更改的。另外你在终端输入vmd能打开这个软件吗？
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I'm Chinese
2楼2011-11-27 10:00:43
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zhangliang8

木虫 (正式写手)

木虫之友
引用回帖:
2楼: Originally posted by usoado at 2011-11-27 10:00:43:
我从网站上下载的VMD，放在了后面/home/myname 的主目录里面。直接输入后就OK了，没有地方需要更改的。另外你在终端输入vmd能打开这个软件吗？

谢谢关注。。。我尝试了安装不同版本的VMD，按照上面的安装命令都是报同样的信息。还是无法查看结果文件，说明安装有问题...很纠结！~
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3楼2011-11-29 18:41:28
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mooninsky

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-11-30 10:28:16
zhangliang8(金币+3): 谢谢你的建议！~我在终端输入vmd可以打开的 2011-12-01 19:57:16
运行vmd打不开，不过直接双击vmd，在终端中运行就能打开了。
搂在的应该是安装成功了，你在bin文件中，双击vmd，在终端中运行就能打开了。
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珏
4楼2011-11-30 10:13:34
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phq323

至尊木虫 (职业作家)
俺也遇到了同样的问题啊，不知道大家是怎么解决到？
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顶帖也是一种收获！
5楼2011-12-10 10:53:57
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zhangliang8

木虫 (正式写手)

木虫之友
★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-12-10 22:27:55
引用回帖:
5楼: Originally posted by phq323 at 2011-12-10 10:53:57:
俺也遇到了同样的问题啊，不知道大家是怎么解决到？

不知道你的问题解决没？我按照楼上的建议，直接在终端输入vmd是可以打开软件的，然后手动把结果文件导入进去，OK！~
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6楼2011-12-10 22:05:59
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phq323

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zhangliang8 at 2011-12-10 22:05:59:
不知道你的问题解决没？我按照楼上的建议，直接在终端输入vmd是可以打开软件的，然后手动把结果文件导入进去，OK！~

还是打不开，出现了下面的问题。
[root@shr /]# vmd
Info) VMD for LINUX, version 1.9 (March 14, 2011)
Info) http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/                        
Info) Email questions and bug reports to vmd@ks.uiuc.edu           
Info) Please include this reference in published work using VMD:   
Info)    Humphrey, W., Dalke, A. and Schulten, K., `VMD - Visual   
Info)    Molecular Dynamics', J. Molec. Graphics 1996, 14.1, 33-38.
Info) -------------------------------------------------------------
Info) Multithreading available, 2 CPUs detected.
Info) Free system memory: 3308MB (84%)
Info) No CUDA accelerator devices available.
Warning) Detected X11 'Composite' extension: if incorrect display occurs
Warning) try disabling this optional X server feature.
Info) OpenGL renderer: Mesa DRI Intel(R) G41 GEM 20100330 DEVELOPMENT
Info)   Features: STENCIL MDE CVA MTX NPOT PP PS GLSL(OVF)
Info)   Full GLSL rendering mode is available.
Info)   Textures: 2-D (4096x4096), 3-D (256x256x256), Multitexture (8)
Info) Dynamically loaded 2 plugins in directory:
Info) /usr/local/lib/vmd/plugins/LINUX/molfile
rlwrap: warning: vmd killed by SIGSEGV (core dumped).
rlwrap has not crashed, but for transparency,
it will now kill itself with the same signal
Segmentation fault (core dumped)

大家看看怎么解决？
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顶帖也是一种收获！
7楼2011-12-11 09:14:18
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剑雪封侯

新虫 (小有名气)
大神们，VMD在哪个网站下载啊？谢谢
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8楼2012-07-01 20:46:39
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my1003

铁杆木虫 (著名写手)
★
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-07-17 07:50:00
http://www.ks.uiuc.edu/Developme ... cgi?PackageName=VMD

可以在这下
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仰望星空，脚踏实地！
9楼2012-07-16 21:37:36
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