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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 用什么技术突变蛋白质的某个氨基酸。
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jackyma

新虫 (小有名气)
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西瓜(金币+3): Good！辛苦！ 2011-11-22 17:36:42
引用回帖:
10楼: Originally posted by yutao_82 at 2011-11-22 09:25:59:
如果是有原子坐标的数据，理论上用软件VMD就可以实现，
不过用实验的方法我的确不懂，希望对你有所帮助。

pymol可以做到你的要求。
简单的步骤：
1.用pymol 打开PDB文件
2.选中你要突变的氨基酸
3.Wizard-->mutagenesis
4.在PyMol Viewer 窗口右侧出现Mutagenesis的系列相关按钮。
点击”No Mutation“，在弹出窗口选择你想突变成那种氨基酸/
这样你选择的氨基酸就会突变成你希望的氨基酸了。
5.最后保存选择”save molecular“

[ Last edited by jackyma on 2011-11-22 at 11:39 ]
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11楼2011-11-22 11:38:06
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匿名

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西瓜: 楼上说的是设计实验的方法。如果你不知道DNA对应蛋白质的密码子，可以用他的方法。 2011-11-22 17:37:25
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12楼2011-11-22 15:02:36
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0624410024

金虫 (正式写手)

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西瓜(金币+1): 鼓励交流！不过一般情况下，突变DNA，更好保存，而且可以大量表达需要的蛋白质。蛋白质本身没有DNA稳定，而且不容易获得大量产物。感觉直接从氨基酸入手有点费力不讨好啊。 2011-11-22 17:41:06
引用回帖:
11楼: Originally posted by jackyma at 2011-11-22 11:38:06:
pymol可以做到你的要求。
简单的步骤：
1.用pymol 打开PDB文件
2.选中你要突变的氨基酸
3.Wizard-->mutagenesis
4.在PyMol Viewer 窗口右侧出现Mutagenesis的系列相关按钮。
点击”No Mutation“， ...

蛋白质定点或者非定点突变都是从改变其核苷酸序列起步的。现在的技术能不能直接从蛋白质的氨基酸本身入手，让其定点突变呢？
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13楼2011-11-22 15:08:28
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匿名

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14楼2011-11-22 15:13:11
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0624410024

金虫 (正式写手)

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西瓜(金币+2): 有想法啊！ 2011-11-22 17:38:49
引用回帖:
14楼: Originally posted by 逐玉 at 2011-11-22 15:13:11:
这有些困难，因为蛋白质具有功能，行使功能时不便打扰！哈哈
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

但是如果我们换一个角度想，蛋白质的氨基酸为化学分子吧？一种化学分子通过化学变化可以转变为另外一种化学分子的吧？还有就是以我的了解现在有的科学家正在研究直接从氨基酸水平最后组装为有功能的蛋白质！我知道这很困难，不过这个应该也是个好的研究方向吧？~
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15楼2011-11-22 15:19:51
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匿名

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16楼2011-11-22 15:26:59
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0624410024

金虫 (正式写手)

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西瓜(金币+1): 辛苦！ 2011-11-22 17:41:25
引用回帖:
16楼: Originally posted by 逐玉 at 2011-11-22 15:26:59:
俺刚开始学，不敢乱想，只想先把基础学好。至于创新，为时尚早！哪位能把大致步骤讲一下？谢谢！
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

http://atgc.dxy.cn/bbs/thread/4879788?keywords=蛋白质定点突变#4879788网上有很多的！楼主辛苦地找一找吧~~~
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17楼2011-11-22 15:35:01
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匿名

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18楼2011-11-22 15:45:06
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19楼2011-11-22 20:53:22
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exon2002

铁杆木虫 (著名写手)
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西瓜(金币+2): Good！ 2011-11-23 17:59:36
如果是在N端或C端就直接通过PCR引物设计来完成，如果在中间也可以通过引物设计完成，只是要分段PCR，最后用两段产物做底物，用5‘端和3’端引物做合成拼接。
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20楼2011-11-23 07:09:49
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