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lengfeng0210

铜虫 (初入文坛)

[交流] 关于基因组选择育种问题

请高手指点下，要做基因组选择育种，目前已经完成了全基因组测序，那么下面该干什么工作呢？
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1楼 2011-11-19 21:25:08
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wanhscn

木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
lengfeng0210(金币+1): 2011-11-20 11:07:48
测序的序列全部组装完了吗？
如果没有组装，还得把它拼起来！
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2楼2011-11-19 22:06:20
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礼仪仁智信

至尊木虫 (著名写手)
同样的问题……
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3楼2011-11-19 22:24:24
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xuyuhuicai

铜虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
lengfeng0210(金币+1): 2011-11-20 11:08:04
找到和相关优良性状紧密连锁的SNPs，然后进行MAS。（动物也这样？）
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4楼2011-11-19 22:29:03
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lengfeng0210

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wanhscn at 2011-11-19 22:06:20:
测序的序列全部组装完了吗？
如果没有组装，还得把它拼起来！

已经拼接好，并绘制成了图谱，下一步是否就是如四楼所说，寻找想要的snp呢？
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5楼2011-11-20 11:07:09
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syjun2003

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
不一样吧，你还是读读文献，基因组选择育种英文应该genomic selection，mas是分子辅助育种，主要是QTL定位和关联分析，所以应该是不一样的。我觉得这样的问题应该自己去读论文，看书，而不是来小木虫。自己连概念都不清楚，问出来也没意思。
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6楼2011-11-20 12:11:02
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wanhscn

木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by lengfeng0210 at 2011-11-20 11:07:09:
已经拼接好，并绘制成了图谱，下一步是否就是如四楼所说，寻找想要的snp呢？

下一步,就是寻找与育种性状相关的基因组区域以及基因,并进行功能的验证.
然后可以在种质资源中寻找优异的基因,然后利用育种方法配合分子标记选择,设计并优化这些与育种相关的基因组区域.
目前主要的任务还是要准确的寻找育种相关的基因组区域以及基因!设计育种时间还长.
寻找育种相关的基因组区域有以下方法:QTL分析,关联分析,选择区域的扫描分析,或者生物信息学分析基因功能并转基因验证!
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7楼2011-11-20 12:59:46
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changwa

铜虫 (小有名气)
我也正在学习呢
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8楼2011-11-20 18:43:32
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wandou399

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
找出有利基因进行克隆或分析。
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9楼2011-11-21 08:43:59
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