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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » towhee 7.0.1 新特性
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043114076

木虫 (正式写手)

[交流] towhee 7.0.1 新特性 已有2人参与

实际上towhee 7.0.1 并没有特别大的更新, 以下是主要的改变:

1. 最大的改动是增加了3种新的随机数生成器. 默认的随机数生成器也由RANLUX 改为 DX-1597-2-7. 新的生成器速度加快了20%, 随机周期由10^(171)增加到了10^(14903). 输入文件的相关设置也作了调整, 但是如果是使用默认值, 则不需要调整任何参数.

2. 第二个改变是增加了输入文件towhee_citations, 其中包含了模拟参数的参考文献. 这一点对于不熟悉 monte carlo 的学生特别有用. 目前这一文件只会输出随机数生成器和系综的相关文献, 以后会加入力场和 monte carlo 移动的相关文献.
从这一点上说, towhee 更像是学生实验的平台.

3.文件格式的改变. 如果在towhee 7 中要使用 towhee 6.2.16-29 的文件towhee_initial/towhee_final, 需要把第一行的6 改为-6. 但是这一方法对于其他版本是不适用的.

4. 由于随机数生成器的改变实际上并不会影响结果, Example 下的文件只是做了顺序的调整, 没有其他改变.

具体参考: http://sourceforge.net/mailarchi ... m_name=towhee-users
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1楼 2011-11-17 23:14:03
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xiaoyang2011

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
师兄，您好，我是刚刚接触分子模拟和Towhee（就是7这一版）这个软件的，课题组以前也不做分子模拟这一块，可以问问具体的安装步骤和安装条件吗？我按手册上的都无法安装，谢谢啦~
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略懂编程的化工研发员
2楼2011-11-18 11:19:19
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043114076

木虫 (正式写手)
★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-11-19 11:29:46
参考 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2074739
给出错误信息才能帮你分析
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3楼2011-11-18 21:01:34
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sys_gintama

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你好！我也是刚接触towhee进行MC模拟气液平衡，通过对纯水进行模拟，发现气相接受率一直在90%—100%之间，与50%相差特别多，您遇到过这样的问题么？能给点意见么？谢谢！
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有些事情，只是想，一定不能成功；尝试去做，有可能成功。
4楼2015-11-24 18:38:24
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043114076

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sys_gintama at 2015-11-24 18:38:24
你好！我也是刚接触towhee进行MC模拟气液平衡，通过对纯水进行模拟，发现气相接受率一直在90%—100%之间，与50%相差特别多，您遇到过这样的问题么？能给点意见么？谢谢！

气相密度低，接受率很高也很正常。
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sys_gintama
5楼2015-11-25 13:13:31
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sys_gintama

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送红花一朵
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5楼: Originally posted by 043114076 at 2015-11-25 13:13:31
气相密度低，接受率很高也很正常。...

嗯嗯，谢谢您的解答！师兄，还有一事想请教您，我在进行纯水的气液平衡模拟时，用NVT系综模拟气液两相，如果不设置两相间粒子交换可以达到一种平衡，而且此时气液两相密度比较准确，气相压力也比较准。但是设置两相粒子交换后，液相密度变大，气相密度和压力减小，偏离平衡值。这种现象应该是存在什么问题呢？师兄能指点一下么？谢谢！
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有些事情，只是想，一定不能成功；尝试去做，有可能成功。
6楼2015-11-25 16:33:38
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043114076

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by sys_gintama at 2015-11-25 16:33:38
嗯嗯，谢谢您的解答！师兄，还有一事想请教您，我在进行纯水的气液平衡模拟时，用NVT系综模拟气液两相，如果不设置两相间粒子交换可以达到一种平衡，而且此时气液两相密度比较准确，气相压力也比较准。但是设置两相 ...

- NVT时是一个盒子吗，还是两个盒子？
- 偏离平衡值，如果在误差范围内是没有问题的。
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7楼2015-11-26 08:39:48
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sys_gintama

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by 043114076 at 2015-11-26 08:39:48
- NVT时是一个盒子吗，还是两个盒子？
- 偏离平衡值，如果在误差范围内是没有问题的。...

师兄，你好。我在NVT模拟时是建立了两个盒子，一个气相，一个液相。不进行粒子交换时，误差可以控制在5%以内，进行粒子交换时，误差就会很大，气相粒子倾向于向液相盒子移动。。。请您赐教。谢谢！
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8楼2015-11-26 09:55:27
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