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717414324

金虫 (小有名气)

[求助] MS求助

如何构建一个规定直径的水分子球
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1楼 2011-11-15 13:17:42
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pfabc0826

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
zh1987hs(金币+1): 谢谢 2011-11-18 20:57:04
717414324(金币+10): 2011-11-21 14:22:43
用粗粒化模型DPD应该可以
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2楼2011-11-18 20:43:04
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c25968

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-11-19 11:28:57
给你看一篇文章Molecular Simulation
Vol. 34, Nos. 10–15, September–December 2008, 1209–1214
Design of highly selective industrial performance chemicals: a molecular modelling approach
Beena Rai* and Pradip
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3楼2011-11-18 22:44:39
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717414324

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by c25968 at 2011-11-18 22:44:39:
给你看一篇文章Molecular Simulation
Vol. 34, Nos. 10–15, September–December 2008, 1209–1214
Design of highly selective industrial performance chemicals: a molecular modelling approach
Beena Ra ...

谢谢
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4楼2011-11-21 14:24:16
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚
★ ★
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-11-21 21:03:17
AC模块 + atom selection工具
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5楼2011-11-21 17:00:46
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717414324

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by xujc1983 at 2011-11-21 17:00:46:
AC模块 + atom selection工具

简洁易懂  谢谢
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6楼2011-11-24 09:34:21
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717414324

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by xujc1983 at 2011-11-21 17:00:46:
AC模块 + atom selection工具

AC中构建的水分子  如何找出中心水分子  有简便方法吗  ？？
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7楼2011-11-24 09:38:48
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚
引用回帖:
7楼: Originally posted by 717414324 at 2011-11-24 09:38:48:
AC中构建的水分子  如何找出中心水分子  有简便方法吗  ？？

那为什么非得中心位置有一个水呢？
何不这样，晶格中心位置放一个C原子，用于定位，并作为原子选择时的球心，然后壳层结构建好后再把C原子删掉
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8楼2011-11-24 09:44:26
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717414324

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by xujc1983 at 2011-11-24 09:44:26:
那为什么非得中心位置有一个水呢？
何不这样，晶格中心位置放一个C原子，用于定位，并作为原子选择时的球心，然后壳层结构建好后再把C原子删掉

具体应该怎么建呢？？不是很明白   我建的是包含4000个水的格子  然后从里面选出一个球来  包含一定需要数目的球。
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9楼2011-11-24 11:11:43
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