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banyihui7500

木虫 (小有名气)

[求助] 真菌新种鉴定

最近从植物根内分离得到一株真菌，用真菌通用引物ITS1和ITS4扩增，克隆测序后，在NCBI上比对，发现和我的序列最接近的是三个不同属的序列，最大相似度分别是90%，87%，87%。能确定这是一个新种吗，如不能确定还需要做哪些工作？谢谢。
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1楼 2011-11-07 22:33:43
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banyihui7500

木虫 (小有名气)
如果单靠ITS的鉴定能确定是吗？目前连是哪个属都无法确定，而且这株真菌不产孢，正在做胁迫处理。如果想靠这个新种发一篇文章，还要做哪些工作？谢谢！
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3楼2011-11-10 10:33:54
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qfw_68

版主 (文坛精英)

有尾巴的青蛙

【答案】应助回帖

banyihui7500(金币+2, 博学EPI+1): 2011-11-10 10:10:14
可以认为是新菌种。
一般序列相似度在97%以上就可以认为是同种菌种。
https://www.zoonbio.com/molecula ... identification.html
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没有困难创造困难也要上网。
2楼2011-11-09 08:42:31
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