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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 请问在Gaussian计算中怎样考虑弱相互作用？
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helitrope

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
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7楼: Originally posted by 043114076 at 2011-11-04 16:15:06:
个人认为, B97D 和 M062x

您好，非常感谢您的回复！
还有个小问题，请问您推荐的这两种方法在G03中能实现吗？好像很多考虑弱相互作用的方法都是最近几年才发展起来的。
在sobereva的文章中提到MOPAC中的PM6-DH+这种方法，所以我准备先用MOPAC这个软件做一做。
还有个小问题请您帮我解答一下，我可不可以只用MOPAC优化结构，因为他的PM6-DH+(在G03中貌似还没有这种方法)，然后再G-03中用MP2等方法，或者您推荐的方法计算能量/相互作用能？
再一次非常感谢您的回复！！
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11楼2011-11-04 22:13:55
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helitrope

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
内容已删除
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12楼2011-11-04 22:18:15
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043114076

木虫 (正式写手)
★
zhou2009(金币+1): 2011-11-06 18:15:53
引用回帖:
11楼: Originally posted by helitrope at 2011-11-04 22:13:55:
您好，非常感谢您的回复！
还有个小问题，请问您推荐的这两种方法在G03中能实现吗？好像很多考虑弱相互作用的方法都是最近几年才发展起来的。
在sobereva的文章中提到MOPAC中的PM6-DH+这种方法，所以我准备先用 ...

gaussian 09 中已经有了
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helitrope
13楼2011-11-05 11:57:30
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helitrope

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
13楼: Originally posted by 043114076 at 2011-11-05 11:57:30:
gaussian 09 中已经有了

恩，非常感谢您！
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14楼2011-11-05 12:27:06
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zmcommon

木虫 (小有名气)
★ ★
zhou2009(金币+2): 2011-11-06 18:16:29
M06只能用G09算，03不支持这个方法，如果用03的话可以试试B3LYP，我算过一个大体系，对比过M06和B3LYP，和实验值不会差很多，两个π堆积体系，一个是M06的结果好，另外一个是B3的好。
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helitrope
15楼2011-11-05 19:00:28
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yongleli

木虫 (正式写手)
★ ★
zhou2009(金币+2): 2011-11-06 18:16:54
引用回帖:
15楼: Originally posted by zmcommon at 2011-11-05 19:00:28:
M06只能用G09算，03不支持这个方法，如果用03的话可以试试B3LYP，我算过一个大体系，对比过M06和B3LYP，和实验值不会差很多，两个π堆积体系，一个是M06的结果好，另外一个是B3的好。

GAMESS里边这些泛函都支持！不要钱儿！
就是慢了点！不过最近好像有GPU版了！
楼主买一块GPU吧！
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helitrope
16楼2011-11-05 19:34:22
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helitrope

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
15楼: Originally posted by zmcommon at 2011-11-05 19:00:28:
M06只能用G09算，03不支持这个方法，如果用03的话可以试试B3LYP，我算过一个大体系，对比过M06和B3LYP，和实验值不会差很多，两个π堆积体系，一个是M06的结果好，另外一个是B3的好。

非常感谢您分享您宝贵的经验！！
因为之前了解到DFT方法在计算弱相互作用方面存在缺陷，所以希望能够找到一种合适的方法。
我的体系是蛋白-配体相互作用体系，它们之间主要是疏水相互作用。
呵呵，非常感谢您分享您的经验！
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17楼2011-11-05 20:22:58
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helitrope

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
16楼: Originally posted by yongleli at 2011-11-05 19:34:22:
GAMESS里边这些泛函都支持！不要钱儿！
就是慢了点！不过最近好像有GPU版了！
楼主买一块GPU吧！

呵呵，非常谢谢您的回复！
早就听闻GAMES大名了，可是同时 也听说这个软件很难学，所以一直没有勇气去碰它。
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18楼2011-11-05 20:25:08
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yongleli

木虫 (正式写手)
★ ★
zhou2009(金币+2): 2011-11-13 13:55:51
引用回帖:
15楼: Originally posted by zmcommon at 2011-11-05 19:00:28:
M06只能用G09算，03不支持这个方法，如果用03的话可以试试B3LYP，我算过一个大体系，对比过M06和B3LYP，和实验值不会差很多，两个π堆积体系，一个是M06的结果好，另外一个是B3的好。

b3lyp算弱相互作用跟实验值接近只有一个解释：

误差相消。

原理上是没人认可b3lyp能算弱相互作用的
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19楼2011-11-10 13:42:32
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daiyulan85

木虫 (正式写手)
★ ★
zhou2009(金币+2): 2011-11-13 13:56:20
引用回帖:
19楼: Originally posted by yongleli at 2011-11-10 13:42:32:
b3lyp算弱相互作用跟实验值接近只有一个解释：

误差相消。

原理上是没人认可b3lyp能算弱相互作用的

可是试试b3lyp-dcp
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计算化学光谱
20楼2011-11-10 16:58:15
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