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huazhorg

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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10楼: Originally posted by fzuvivi at 2011-11-03 09:57:21:
我原来用的是4.1.2的，直接configure然后make all，其CPU利用率能达到95以上。同样，我4.3.1也是直接configure然后make all， 并行环境是有的，就是利用率很低。望多指教。。我的并行是mpich2.

你试试用openmpi，我用它一直效率挺高的。
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11楼2011-11-03 11:33:22
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fzuvivi

金虫 (小有名气)
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11楼: Originally posted by huazhorg at 2011-11-03 11:33:22:
你试试用openmpi，我用它一直效率挺高的。

openmpi安装会不会和mpich2有冲突，我目前其他的并行软件都是用mpich2装的。。
对了，我的red hat的集群。ifort和gfrotran都有应该。
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12楼2011-11-03 16:03:44
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huazhorg

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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12楼: Originally posted by fzuvivi at 2011-11-03 16:03:44:
openmpi安装会不会和mpich2有冲突，我目前其他的并行软件都是用mpich2装的。。
对了，我的red hat的集群。ifort和gfrotran都有应该。

不会，给安装的openmpi指定位置，让quantum espresso 专门用它来并行计算，不影响其他软件
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13楼2011-11-03 17:07:55
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fzuvivi

金虫 (小有名气)
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13楼: Originally posted by huazhorg at 2011-11-03 17:07:55:
不会，给安装的openmpi指定位置，让quantum espresso 专门用它来并行计算，不影响其他软件

这个怎么做？是先安装好openmpi，然后在configure pwscf的时候指定并行编译环境为openmpi吗？我想实现mpich2和openmpi在不同程序里，同时都能用。谢谢了～


也谢谢LZ，一直在你这边借贴求助～呵呵！
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14楼2011-11-03 19:37:39
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huazhorg

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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14楼: Originally posted by fzuvivi at 2011-11-03 19:37:39:
这个怎么做？是先安装好openmpi，然后在configure pwscf的时候指定并行编译环境为openmpi吗？我想实现mpich2和openmpi在不同程序里，同时都能用。谢谢了～


也谢谢LZ，一直在你这边借贴求助～呵呵！

对的，就是先安装好openmpi，然后在configure pwscf的时候指定并行编译环境为openmpi。
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15楼2011-11-04 10:00:31
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fzuvivi

金虫 (小有名气)
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15楼: Originally posted by huazhorg at 2011-11-04 10:00:31:
对的，就是先安装好openmpi，然后在configure pwscf的时候指定并行编译环境为openmpi。

对不起，再请问下，昨晚我把openmpi装上去了，本身测试可以的，然后用这个openmpi编译pw，想测试下，发现pw.x老是找不到一些共享lib，是不是要静态安装openmpi才行啊？
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16楼2011-11-04 10:29:03
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huazhorg

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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16楼: Originally posted by fzuvivi at 2011-11-04 10:29:03:
对不起，再请问下，昨晚我把openmpi装上去了，本身测试可以的，然后用这个openmpi编译pw，想测试下，发现pw.x老是找不到一些共享lib，是不是要静态安装openmpi才行啊？

只要是正确安装，环境变量设置好了，pw会自动探测到openmpi的并行环境的，这个安装不难，成功率还是相当高的。不知道你系统的具体情况。
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17楼2011-11-04 10:36:37
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

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16楼: Originally posted by fzuvivi at 2011-11-04 10:29:03:
对不起，再请问下，昨晚我把openmpi装上去了，本身测试可以的，然后用这个openmpi编译pw，想测试下，发现pw.x老是找不到一些共享lib，是不是要静态安装openmpi才行啊？

OpenMPI和MPICH在使用上的最大区别是，MPICH之需要把bin目录放到环境变量就可以了，OpenMPI还需要把lib目录加入到库环境变量中。
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思想重于技巧，内涵重于表象
18楼2011-11-04 12:40:12
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fzuvivi

金虫 (小有名气)
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18楼: Originally posted by souledge at 2011-11-04 12:40:12:
OpenMPI和MPICH在使用上的最大区别是，MPICH之需要把bin目录放到环境变量就可以了，OpenMPI还需要把lib目录加入到库环境变量中。

你指的lib加入库环境中是不是在.bashrc中设置lib的环境？我试过了，可以编译得到的pw不能用，编译过程没有出现任何问题。openmpi本身貌似可以用。我的是redhat系统，ifort编译器（intel）。还望指教～谢谢
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19楼2011-11-04 16:17:49
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