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huazhorg

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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10楼: Originally posted by fzuvivi at 2011-11-03 09:57:21:
我原来用的是4.1.2的,直接configure然后make all,其CPU利用率能达到95以上。同样,我4.3.1也是直接configure然后make all, 并行环境是有的,就是利用率很低。望多指教。。我的并行是mpich2.

你试试用openmpi,我用它一直效率挺高的。
11楼2011-11-03 11:33:22
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fzuvivi

金虫 (小有名气)

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11楼: Originally posted by huazhorg at 2011-11-03 11:33:22:
你试试用openmpi,我用它一直效率挺高的。

openmpi安装会不会和mpich2有冲突,我目前其他的并行软件都是用mpich2装的。。
对了,我的red hat的集群。ifort和gfrotran都有应该。
12楼2011-11-03 16:03:44
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huazhorg

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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12楼: Originally posted by fzuvivi at 2011-11-03 16:03:44:
openmpi安装会不会和mpich2有冲突,我目前其他的并行软件都是用mpich2装的。。
对了,我的red hat的集群。ifort和gfrotran都有应该。

不会,给安装的openmpi指定位置,让quantum espresso 专门用它来并行计算,不影响其他软件
13楼2011-11-03 17:07:55
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fzuvivi

金虫 (小有名气)

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13楼: Originally posted by huazhorg at 2011-11-03 17:07:55:
不会,给安装的openmpi指定位置,让quantum espresso 专门用它来并行计算,不影响其他软件

这个怎么做?是先安装好openmpi,然后在configure pwscf的时候指定并行编译环境为openmpi吗?我想实现mpich2和openmpi在不同程序里,同时都能用。谢谢了~


也谢谢LZ,一直在你这边借贴求助~呵呵!
14楼2011-11-03 19:37:39
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huazhorg

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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14楼: Originally posted by fzuvivi at 2011-11-03 19:37:39:
这个怎么做?是先安装好openmpi,然后在configure pwscf的时候指定并行编译环境为openmpi吗?我想实现mpich2和openmpi在不同程序里,同时都能用。谢谢了~


也谢谢LZ,一直在你这边借贴求助~呵呵!

对的,就是先安装好openmpi,然后在configure pwscf的时候指定并行编译环境为openmpi。
15楼2011-11-04 10:00:31
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fzuvivi

金虫 (小有名气)

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15楼: Originally posted by huazhorg at 2011-11-04 10:00:31:
对的,就是先安装好openmpi,然后在configure pwscf的时候指定并行编译环境为openmpi。

对不起,再请问下,昨晚我把openmpi装上去了,本身测试可以的,然后用这个openmpi编译pw,想测试下,发现pw.x老是找不到一些共享lib,是不是要静态安装openmpi才行啊?
16楼2011-11-04 10:29:03
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huazhorg

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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16楼: Originally posted by fzuvivi at 2011-11-04 10:29:03:
对不起,再请问下,昨晚我把openmpi装上去了,本身测试可以的,然后用这个openmpi编译pw,想测试下,发现pw.x老是找不到一些共享lib,是不是要静态安装openmpi才行啊?

只要是正确安装,环境变量设置好了,pw会自动探测到openmpi的并行环境的,这个安装不难,成功率还是相当高的。不知道你系统的具体情况。
17楼2011-11-04 10:36:37
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

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16楼: Originally posted by fzuvivi at 2011-11-04 10:29:03:
对不起,再请问下,昨晚我把openmpi装上去了,本身测试可以的,然后用这个openmpi编译pw,想测试下,发现pw.x老是找不到一些共享lib,是不是要静态安装openmpi才行啊?

OpenMPI和MPICH在使用上的最大区别是,MPICH之需要把bin目录放到环境变量就可以了,OpenMPI还需要把lib目录加入到库环境变量中。
思想重于技巧,内涵重于表象
18楼2011-11-04 12:40:12
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fzuvivi

金虫 (小有名气)

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18楼: Originally posted by souledge at 2011-11-04 12:40:12:
OpenMPI和MPICH在使用上的最大区别是,MPICH之需要把bin目录放到环境变量就可以了,OpenMPI还需要把lib目录加入到库环境变量中。

你指的lib加入库环境中是不是在.bashrc中设置lib的环境?我试过了,可以编译得到的pw不能用,编译过程没有出现任何问题。openmpi本身貌似可以用。我的是redhat系统,ifort编译器(intel)。还望指教~谢谢
19楼2011-11-04 16:17:49
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