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bioqu

银虫 (正式写手)

[求助] 急!请问改图是如何做出来的?

请问附件里的图是如何做出来的?
即:在骨架上能用不同颜色标示单个氨基酸,并用绿色圆晕显示出来,N和C端用圆点标示。
谢谢!
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loudonghua

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

bioqu(金币+10): 谢谢!就是那个绿色圆晕的颜色没有PDF中的浓,不是很明显。再送你朵红花,谢谢! 2011-10-28 20:11:56
御剑江湖(模拟EPI+1): 谢谢 2011-10-29 09:55:53
可以利用VMD做出来,具体过程如下:
现在VMD中载入你的蛋白质分子,在VMDmain选择Graphics-->Graphiccal Representations,打开对话框之后,在selected atoms中选all在Drawing style 中coloring Method 选colorID 7,drawing method 选lines;点击create Rep,在select atoms用命令resid   氨基酸序号 and name C或者N段原子名称,然后再在Drawing style 中coloring Method 选colorID 选所需要的颜色 ,drawing method 选VDW;点击create Rep,在select atoms用命令Resname  氨基酸名字如RLN,然后再在Drawing style 中coloring Method 选colorID 选所需要的颜色 ,drawing method 选所需要的表示法;





2楼2011-10-28 11:08:53
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loudonghua

银虫 (初入文坛)

★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-10-30 16:27:24
对于绿色圆晕你可以试一试coloring MEthod 后面的一些修饰方法,可以将圆晕表示出来的
3楼2011-10-29 09:25:18
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