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guolianshun

金虫 (著名写手)

[交流] 用Origin画MS中电子云密度的技术!!!超漂亮 已有8人参与

用Origin画MS中电子云密度的技术!!!超漂亮
有心人可以研究一下!!!

版主请加精啊,
费了好大力气的!
呵呵!
欢迎大家学习!

MATLAB程序用来处理MS电荷密度的等高线做法,分四步:
1.找到电荷密度图的存储文件,一般是在自己所建的计算project中,隐藏的,castep模块是.charg_frm格式的,可以用txt打开后另存为txt格式。(这个地方注意把文件单独拷贝出来,以免破坏原始文件)
2.读取数据,在matlab命令里输入一下命令:
[path,fn]=uigetfile('*.txt','Open');
fp=fopen([fn,path],'r');
head=fscanf(fp,'%s',4);
data=fscanf(fp,'%f',[4,18*18*144]);
fclose(fp);
这是读取刚才保存的txt数据的,其中18*18*144是可以改的,分别对应a,b,c的重复单元。
3.作矩阵。
a=reshape(data(1,,[18,18,144]);
b=reshape(data(2,,[18,18,144]);
c=reshape(data(3,,[18,18,144]);
d=reshape(data(4,,[18,18,144]);
其中18*18*144是可以改的,分别对应a,b,c的重复单元,即长宽高的值。
4.作等高线图
layer=1;
contour(reshape(a(:,layer,,[18,144]),reshape(c(:,layer,,[18,144]),reshape(d(:,layer,,[18,144]),8);
layer=1(2,3,4....) 可以修改作图的层数,分别是从前面到后面。最后的8表示显示线条数目,可以自己修改成9,10或其它。
hold on 表示累积作图,hold off表示清空前面的 作图
举例;做表面层和第九层的等高线图
>> layer=9;
contour(reshape(a(:,layer,,[18,144]),reshape(c(:,layer,,[18,144]),reshape(d(:,layer,,[18,144]),8);
>> hold on
>> layer=1;
contour(reshape(a(:,layer,,[18,144]),reshape(c(:,layer,,[18,144]),reshape(d(:,layer,,[18,144]),8);
这是沿侧面做等高线(即xz平面),其它方向作图类似。只要修改其中的参数就可以了,如把a(:,layer,,[18,144]),reshape(c(:,layer,,[18,144]),reshape(d(:,layer,,[18,144]),8);
改为a(layer,:,,[18,144]),reshape(c(layer,l:,,[18,144]),reshape(d(layer,:,,[18,144]),8);
一个牛人的总结,转自分子论坛。
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