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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 截断半径
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wangzhikun

金虫 (小有名气)

[求助] 截断半径

本人系初学者，请问在分子力场中截断半径如何选取啊？
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微笑，便是最好的生活态度。
1楼 2011-10-09 21:08:50
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-10-24 10:37:28
引用回帖:
1楼: Originally posted by wangzhikun at 2011-10-09 21:08:50:
本人系初学者，请问在分子力场中截断半径如何选取啊？

截断半径必须小于分子动力学模拟盒子最短边长的一半。。。
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wangzhikun
好好学习，天天向上。
4楼2011-10-23 17:01:51
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gyldmy

铜虫 (小有名气)
★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-10-10 17:51:16
不知道你用的是什么模块，我用的是discover模块！modules-discover-setup-energy然后点击moer就能看见cutoff了，这就是截断半径
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2楼2011-10-09 21:46:51
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长空一笑

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
wangzhikun(金币+5): 感激不尽！！！ 2011-10-12 12:28:10
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-10-13 13:09:44
（1）查文献，最好是依据其他人有依据的情况下选取的戒指半径；
（2）如果没有查到，可以经验性地取0势能距离的2.5倍；
（3）如果是不常见的势能函数，可以画出力随距离变化的曲线，然后取到受力远远小于峰值的距离作为截止半径。
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Keep moving
3楼2011-10-12 09:55:46
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wangzhikun

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by zyj8119 at 2011-10-23 17:01:51:
截断半径必须小于分子动力学模拟盒子最短边长的一半。。。

就是要先知道截断半径，才能确定盒子的最短边长嘛。呵呵，谢谢啦
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微笑，便是最好的生活态度。
5楼2011-10-23 19:09:28
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