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[资源] Gibbs2,省时省力的准第一性原理热力学性能计算软件

首先,本软件基于Quasi-Harmonic Debye模型,与声子谱计算后的QHA模型起源于相同的公式。这是由于在统计热力学中,零点和振动自由能只能被定义为声子在FBZ内的积分。
其次,本软件使用其他第一性原理计算得到的E-V曲线和弹性泊松比来拟合EOS并且进一步拟合热力学性能。具体的是把声子与声速进行关联,分类成纵/横两种声速,然后纵/横声速又对应了弹性常数C11和C12(仅限各向同性材料,其只有两个相互独立的弹性常数C11和C12),从而完成了声子的积分。
第三,本软件计算效率非常高,无论多么大的体系,只要有E-V曲线,有泊松比,就可以在一秒内得到想要的热力学结果,不占空间不占时间。
第四,2004年左右发布的Gibbs程序使用Fortran 90写成,本此发行的使用bash脚本,不需要进行编译。具体的使用方法可参考Doc中的用户手册。
Gibbs第一版的发布文献:M.A.Blanco, E.Francisco, and V.Luana, Comput. Phys. Commu. 158, 57 (2004)
Gibbs第二版的发布文献:A.Otero-de-la-Roza and V. Luana, Comput. Phys. Commu. 182, 1708-1720 (2011)
           A.Otero-de-la-Roza and V. Luana, Comput. Phys. Commu. 182, 2232-2248 (2011)
文献和软件都附加在了附件中。
顺便提一下个人的观点,不见得正确,还希望有大牛来补充和说明:Debye模型提出的时间是非常早的,至少是在能够计算完整声子谱之前就已经存在的,不知道最早是怎么使用的,但是比较早的计算方面的应用,可以回溯到1988年,由纽约IBM工作的Moruzzi和Janak及维也纳科技大学的Schwarz发表在Phys Rev B, Volume 37, Number 2的论文Calculated thermal Properties of Metals。不知道是否是注意到了Debye模型中对弹性常数的各向同性近似,作者只在文章中计算了与各向同性最相近的立方结构的金属单质(立方体系中有三个相互独立的弹性常数C11,C12和C44)。后来在声子色散谱的计算大量普及之前,也有不少人结合LMTO、LCAO等计算方法,配合Debye模型计算热力学性能的。至于现在,基本主流都是使用声子色散谱+QHA的方法了,在Quantum-ESPRESSO中,甚至给出了三阶非谐波的计算(d3.x)。
另外,由于忽略了声子的计算,也就同时忽略了动力学稳定性的检验,比如虚频的问题。从原始公式可以知道,吉布斯函数中的零点能和振动自由能是需要对声子进行积分的,而虚频的存在则会让公式失去计算意义。但是Debye模型则可以“overcome”这个问题,在我个人看来,这就好像比较ln(-5)和ln(-2)的大小,使用ln(a)=0.5*2ln(a)=0.5*ln(a^2)然后得到ln(-5)>ln(-2)一样不靠谱~
至于E-V的取值,由于EOS对参数非常敏感,所以取值的密度和广度都对最终结果有着非常巨大的影响,如果是为了拟合已有的实验数据或者QHA计算数据,还是比较容易多快好省的做到的。作者使用自己的Gibbs2,在Phys. Rev. B, 84, 024109 (2011)上也发表了一篇文章。不过从我个人观察的来看,除非原创性的,否则比较少见使用该方法的高水平文章。
总之,这样的方法总的来说还是比较考验人的~当然,如果作为对实验的粗略预测,还是有不错的应用的。
最后一说的是,Debye模型一般不被计算领域的人承认为第一性原理方法的。

再补充个第一版的Gibbs,这样就从拟合到计算齐活了~[ Last edited by souledge on 2011-10-25 at 17:46 ]

为照顾部分Windows用户,特此推出编译好的Windows版Gibbs v1.0程序,但是仅限于64-bit的Windows用户使用。
程序可在此帖下载:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4543295&fpage=1

[ Last edited by souledge on 2012-8-15 at 13:42 ]
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3楼2011-09-27 21:37:53
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kuner

铁虫 (正式写手)


楼主,我下载了,有知道Gibbs1的用法,但是对于您说的Gibbs2的文件,我不知道如何实施计算,能否在详细说点,或者说想Gibbs1一样,有*.exe计算程序吗?如何计算呢?谢谢
21楼2011-11-18 21:00:53
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hwceng0816

木虫 (著名写手)


souledge: 取消置顶 2012-08-20 16:44:25
引用回帖:
1932861楼: Originally posted by souledge at 2011-09-27 23:59:37
对于拟合凑数的方法,没多少技术可支持的吧~上个版本的输入文件也非常简单,这个版本的还没有仔细看,因为还是感觉声子法更靠谱。但是对于急着出点文章出点数据的,这个软件还是有用的,所以才发上来。其实我自己对 ...

怎么安装呀 都没有安装文件 ?求指导 能装在windows上面吗?
54楼2012-08-11 16:02:31
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bigseahorse

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

2楼2011-09-27 19:11:40
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引用回帖:
3楼: Originally posted by youzhizhe at 2011-09-27 21:37:53:
谢谢分享。如果能够提供技术支持就更好了。

对于拟合凑数的方法,没多少技术可支持的吧~上个版本的输入文件也非常简单,这个版本的还没有仔细看,因为还是感觉声子法更靠谱。但是对于急着出点文章出点数据的,这个软件还是有用的,所以才发上来。其实我自己对这个方法比较排斥的~
4楼2011-09-27 23:59:37
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kuner

铁虫 (正式写手)


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14楼2011-11-10 00:18:40
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c0308010104

木虫 (小有名气)


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看看先
15楼2011-11-10 09:20:36
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kuner

铁虫 (正式写手)


送鲜花一朵
还有,就是能否将您发的文章发上来,我没有查到,谢谢了先
22楼2011-11-18 21:01:57
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kuner

铁虫 (正式写手)


如果软件不需要编译,那么如何进行计算,在哪里计算呢?请楼主不惜告知,急啊
23楼2011-11-19 20:58:06
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kuangfg1987

至尊木虫 (职业作家)


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souledge: 取消置顶 2012-06-01 18:14:05
引用回帖:
1921200楼: Originally posted by souledge at 2011-09-27 17:44:46:
首先,本软件基于Quasi-Harmonic Debye模型,与声子谱计算后的QHA模型起源于相同的公式。这是由于在统计热力学中,零点和振动自由能只能被定义为声子在FBZ内的积分。
其次,本软件使用其他第一性原理计算得到的E ...

求救,能不能教教我怎么使用阿?
48楼2012-05-18 20:11:50
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