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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸提取 » 软件使用问题
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微笑不彷徨

银虫 (初入文坛)

[求助] 软件使用问题 已有1人参与

各位分子生物学领域的大虾们，可否能给予帮助？
我的研究方向是动物线粒体基因组，目前处于数据处理阶段，问题重重，小女子在此恳求各位大虾们慷慨解囊，知识共享！
在对线粒体编码基因用Clustal比对后，再进行人工校对，以确保在翻译成氨基酸之前，比对序列中的空格前的密码子能被3整除，然后翻译成氨基酸，空格不变，再用MEGA或SeqVerter软件将fasta或gb格式转换成phylip或nexus格式，一切就绪之后，用ProtTest2.4计算氨基酸的最适模型，窗口提示：ProtTest encounted some error. Check the error message in the console.
界面上的说明如下：
java.io.IOException: Cannot run program "D:/program/%e5%88%86%e6%9e%90%e8%bd%af%e4%bb%b6/prottest2.4/ProtTest2.4/bin/phyml-prottest-windows.exe": CreateProcess error=3, ???????
Most errors are related to alignment format problems. Check your alignment, please.
In Windows errors are sometimes related to filenames and file-paths conflicts
In order to circumvent those conflicts place your input files in a lower-level directory (e.g. C）
恳请高手给予指点，不甚感激！
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1楼 2011-09-23 16:19:22
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scyxk

新虫 (初入文坛)
mei ren
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2楼2011-11-04 19:11:04
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)
不是很清楚，不过我对"D:/program/%e5%88%86%e6%9e%90%e8%bd%af%e4%bb%b6/“这个路径有点怀疑。e5%88%86%e6%9e%90%e8%bd%af%e4%bb%b6这个文件夹的名字是中文的吗？国外的软件有的在中文名的文件夹下是不能用的，或者太长的文件夹名字也不行。当然，如果你这软件能用，只是这次出问题，那可以排除这种情况。
如果是刚用就出现问题，可以试试把软件卸载了，再重新安装在英文名的文件夹里（路径上的所有文件夹都用英文名）。
Good luck！
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3楼2011-11-04 23:46:39
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王子陌

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

Error＝13 权限不够 咋办，我换windows系统就能做，但是在ubuntu里报error＝13

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼2018-05-18 17:28:22
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