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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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gyldmy

铜虫 (小有名气)

[求助] MS提交任务

求教在linux上怎么提交MD和DMol3运算的任务?还有一些常用的命令

[ Last edited by gyldmy on 2011-9-21 at 17:16 ]
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theallz

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gyldmy(金币+3): 2011-09-22 08:50:02
贺仪(金币+3): 多谢指教! 2011-09-22 09:53:30
引用回帖:
1楼: Originally posted by gyldmy at 2011-09-21 17:15:20:
求教在linux上怎么提交MD和DMol3运算的任务?还有一些常用的命令
[ Last edited by gyldmy on 2011-9-21 at 17:16 ]

可以在Help当中搜索standalone,有详细的通过命令提交作业的说明。

基本思路是:
1. 建立作业目录
2. 所有input文件(包括构型)上传到服务器;
3. 进入作业目录,使用命令提交作业,例如:
    ~/Accelrys/MaterialsStudio55/etc/DMol3/bin/RunDMol3.sh -q default -np 16 input

使用什么模块,具体使用standalone提交作业的脚本在/Accelrys/MaterialsStudio55/etc/下面的模块目录下bin目录中,可以参考同目录下的Readme文档。
2楼2011-09-22 08:29:52
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