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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » NEB过渡态搜索遇到的问题
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wujing110

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11楼2011-09-20 22:33:38
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cenwanglai

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uuv2010(金币+1): 多谢提示! 2011-09-20 23:22:26
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11楼: Originally posted by wujing110 at 2011-09-20 22:33:38:
还是原来的错误提示

找个简单的,原子少的体系，用简化的INCAR （不确定的就默认，或者注释掉）跑一下看？

看看到底是INCAR的问题还是vasp的问题，还是机器的问题。

·
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12楼2011-09-20 22:38:35
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wujing110

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13楼2011-09-20 22:45:58
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wujing110

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cenwanglai: 我的意思是找个别的简单的体系，仅仅用于测试你的vasp是否能正确运行NEB. 2011-09-20 23:25:14
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14楼2011-09-20 23:20:22
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贺仪(金币+2): 多谢指教！ 2011-09-22 10:18:05
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14楼: Originally posted by wujing110 at 2011-09-20 23:20:22:
怎么进行线性插值在初态和末态之间得到01-04的POSCAR？？
呼叫高手。。。呼叫高手。。。

>nebmake.pl POSCAR.ini POSCAR.end xx

xx = number of images

当 xx=4的时候，就得到00 01 02 03 04 05。其中01~04是插入的images.

nebmake.pl是vtstool脚本包里面的命令。不知道你们机子上安装没。

[ Last edited by cenwanglai on 2011-9-20 at 23:24 ]
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15楼2011-09-20 23:22:52
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wujing110

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16楼2011-09-21 07:35:50
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贺仪(金币+2): 多谢指教！ 2011-09-22 10:18:27
引用回帖:
16楼: Originally posted by wujing110 at 2011-09-21 07:35:50:
nebmake.pl POSCAR.ini POSCAR.end xx
确定是ini么？
我有nebmake.pl小程序。。。可以自己运行么？

单独的nebmake.pl可能无法运行。需要全部的vtstool   code.

nebmake.pl 起始POSCAR  结束POSCAR  image个数

POSCAR.ini表示起始POSCAR。傻孩子，呵呵
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17楼2011-09-21 07:41:45
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wujing110

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18楼2011-09-21 13:10:41
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【答案】应助回帖

wujing110(金币+1): 感谢回帖 2011-09-21 14:18:29
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18楼: Originally posted by wujing110 at 2011-09-21 13:10:41:

偶不是孩子
我把vtstool   code都放在自己的根目录下了
但是提示Permission denied

可能是 权限不够。或者没有修改成可执行的。或者没有放进$PATH环境变量中。

似乎需要配置一下路径。如果你不是系统管理员，可以请管理员帮助你。或者其它懂linux系统的人帮助你。
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19楼2011-09-21 13:44:10
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wujing110

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20楼2011-09-21 14:19:05
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