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wwwkkk83

木虫 (著名写手)

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[资源] 推荐几本生物信息学资料--张闻作品下载

http://wzhangcnster.googlepages.com/
《人类基因聚类》Human Gene Clusters 下载 hgc608.zip
《人类基因聚类》是在《人类基因功能手册》的基础上，对七千多个基因术语进行了基因聚类。全书包括人类基因的细胞成分聚类、分子功能聚类、生命过程聚类、疾病相关基因和英汉基因词汇等五个部分。作为一本查阅和学习人类基因分类和基因术语的工具书，《人类基因辞典》的读者对象包括生物医学研究工作者、教师、学生和相关领域的其他读者。2006年8月发表。

《人类基因功能手册》A Function Index of Human Genes 下载 hg608.zip
《人类基因功能手册》汇集NCBI Gene、Gene Ontology 和OMIM 等数据库中有关人类基因功能的最新资料，对两万多个人类基因的功能进行注解和翻译，内容包括基因的符号、中英文名称、细胞成分、分子功能、生命过程、相关疾病、OMIM 编号和染色体定位等八项内容。书末的人类基因别名索引和英汉基因词汇索引便于读者根据基因别名和英文基因词汇进行基因功能信息查询。《人类基因功能手册》是一本查阅人类基因功能信息和基因术语的工具书，读者对象为生物医学研究者、教师、学生和相关领域的读者。2006年7月发表，2006年8月修订。
人类基因组课件 Human Genome course
研究生课程的课件，根据美国能源部资料整理的人类基因组基本信息。下载 hg-course06.pdf 2006年6月编写。
生物信息学课件 Bioinformatics course
研究生生物信息学课程的课件，仅供参考，请勿传播。下载bicourse.pdf 2006年10月
细胞生物学课件 Cell Biology course
本科细胞生物学课程的课件，仅供参考，请勿传播。下载 cellcourse06.pdf 2006年11月
Python程序
两序列全局比对算法 needleman.py  2006年2月编写。Needleman等1970s提出，著名的动态规划算法。
两序列局部比对算法 waterman.py  2006年2月编写。Smith和Waterman等1980s对Needleman算法的扩展。
序列共同词的Gibbs抽样器 gibbs93.py 2005年12月编写。根据Laurence等1993年的Science论文，运行需要同目录下一个名为sq的序列文件，每条序列为一行，内含一个10字母的共同词（改词长度要改程序中的w），词间可有小的差异。
《蛋白质组学实践》Practical Proteomics
我在University of Nebraska-Lincoln做蛋白质组学研究的总结， proteomicszw.pdf 2005年8月更新。
Cancer Research论文（SCI IF 7.616）: 人癌细胞系NCI60平台中高半胱氨酸关联酶的表达谱
我在University of Nebraska-Lincoln的研究工作，测定美国癌症研究所60种人癌细胞中蛋氨酸依赖性相关酶的表达，分析了蛋白质表达与RNA表达及抗癌化合物活性的相关性，实验检验前列腺癌细胞系的蛋氨酸依赖性的原因。
Expression profiling of homocysteine junction enzymes in the NCI60 panel of human cancer cell lines. 5cr-NCI60.pdf 2005.2
Nucleic Acids Research论文（SCI IF 7.552）: 周期性表达基因的统计复同步和贝叶斯鉴别
我在哈佛的研究工作，用Jun S. Liu教授建立的“周期－正态混合”模型和“Beta混合”模型，鉴别出822个酵母周期性表达基因，分析这些基因的生物学功能发现，大多数与细胞周期各环节的事件密切相关。该方法已被多次引用。
Statistical resynchronization and Bayesian detection of periodically expressed genes 4nar-PNM.pdf 2004.1
ZWBIO生物学信息网
六年前做的网站，仅供参考 zwbio.zip 2000年12月完成。
硕士学位论文：遗传密码和HIV-1融膜肽的生物信息学研究
介绍生物分子数据库GenBank、Swiss-Prot、PDB的使用方法，探索密码子第1、2、3位排布的规律性，分析密码子第3位UC同义替换对mRNA结构的影响，综述HIV的入侵机制，用分子力学方法预测HIV-1融膜肽的结构，最后提出融膜肽功能的“插销”模型。
Bioinformatics studies on the genetic code and HIV-1 fusion peptide zwthesis.zip 1998年6月完成。
http://wzhangcnster.googlepages.com/

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