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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » (求助)进化树分析
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microliu

木虫 (正式写手)

[交流] (求助)进化树分析

利用clustral X做完进化树后,不知道两个菌株之间的数字是什么意思?谁知道说一下,谢谢
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1楼 2006-11-27 11:09:56
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zhaohui-eric

木虫 (著名写手)

可到以下网站查找更好软件

www.cbz.com.cn/
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4楼2006-11-27 19:06:55
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johnsooh

荣誉版主 (正式写手)

此用户来自小木虫总部信号不好

解答

各枝间的bootstrapping(常见100次或1000次)
分叉间数值表示在100或1000次成蔟中该簇出现的频率

[ Last edited by johnsooh on 2006-11-27 at 13:13 ]
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___▂▂▃▄▅▆▇█无信号︻╋████�?
2楼2006-11-27 13:05:36
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microliu

木虫 (正式写手)
临近菌种的同源性用软件怎么计算,请帮忙解释一下,谢谢!
我用clustalx做的进化树
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3楼2006-11-27 16:14:16
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johnsooh

荣誉版主 (正式写手)

此用户来自小木虫总部信号不好
★ ★
dfggc(金币+2):欢迎参与讨论，送两颗巧克力，呵呵。
你可以用MegAlign软件比对相似性
采用PAUP* 4.0软件比对,运用最大简约法（Maximum parsimony，MP）和最大似然法（Maximum likelihood，ML）构建系统发育树.具体算法参见MP&ML.
Clustal X也可以运算,但我们常用来生成图用TREEVIEW看图的 .
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___▂▂▃▄▅▆▇█无信号︻╋████�?
5楼2006-11-27 20:07:10
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