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speio

金虫 (小有名气)

[求助] 求助ms计算天冬氨酸的晶格能,100金币送上

哪一位高手帮忙指出使用ms计算天冬氨酸晶格能(lattice energy)的方法?说出详细的步骤,不要笼统的方法。以及怎样计算天冬氨酸的实验晶格能。真心求助100个金币送上
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coella

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
贺仪(金币+2): 要是能写一篇教程,可以设置为资源供大家学习,这样也会给你增加很多金币 2011-09-14 14:04:28
speio(金币+50): 很好,但是具体的计算步骤还是不是非常的清楚。希望说的明白一点,还有实验报道的值是查文献吗 2011-09-14 16:07:09
我计算过一种氨基酸的晶格能,采用力场的方式,大致跟你说下我的作法吧
首先找到天冬氨酸的晶胞结构,ccdc里面应该有
根据晶格能的定义,计算晶体分子从气态凝聚为晶态时的能量差,这其中还涉及到分子的质子传递能
最重要的是选择力场,我是尝试不同的力场,建立能够使所有非键结能量收敛的新的周期性晶体盒子,之后计算能量,必要的话要先优化结构,晶体库解析出来的结构未必完整,将这个能量减去每个单独分自身具有的能量,再考虑进质子传递能,得到结果。我算出来和实验报道的值出入不算大。
不知道对你是否有帮助!
2楼2011-09-14 10:57:01
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