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jiangnan8015木虫 (正式写手)
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[求助]
求助一个生物学软件structure的用法
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https://bbs.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=344534&do=blog&id=354143 看这个帖子没看懂具体该怎么排列STR(短串联重复序列)的数据格式,请教中 1、待分析数据文件的编辑 可新建文本文件并命名为project_data,以文本编辑的方式编辑数列: 第一列:样品代码,每一样品占两行,每一行为其一个基因型,如样品1的基因型为AA,样品2的基因型为AT,样品3的基因型为TT,则编辑为: 1 1 1 1 2 1 2 2 3 2 3 2 如果有多个等位基因,可以按1,2,3,4,5等顺序编码各样品的基因型;(这个到底怎么排列呢????)第二列:人群代码,即第一群人的代码全为1,第二群人的代码全为2,第三群人的代码全为3; 第三列:位点1的分型结果。如上所述,如果有2个等位基因,可用1、2代表;如果有多个等位基因,可分别以1,2,3,4,5等代表; 第四列:位点2的分型结果。编码方法同上。 |
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