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jiangnan8015

木虫 (正式写手)

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[求助] 求助一个生物学软件structure的用法

https://bbs.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=344534&do=blog&id=354143 看这个帖子没看懂具体该怎么排列STR（短串联重复序列）的数据格式，请教中

1、待分析数据文件的编辑
可新建文本文件并命名为project_data，以文本编辑的方式编辑数列：
第一列：样品代码，每一样品占两行，每一行为其一个基因型，如样品1的基因型为AA，样品2的基因型为AT，样品3的基因型为TT，则编辑为：
1    1
1    1
2    1
2    2
3    2
3    2
如果有多个等位基因，可以按1，2，3，4，5等顺序编码各样品的基因型；（这个到底怎么排列呢？？？？）第二列：人群代码，即第一群人的代码全为1，第二群人的代码全为2，第三群人的代码全为3；
第三列：位点1的分型结果。如上所述，如果有2个等位基因，可用1、2代表；如果有多个等位基因，可分别以1，2，3，4，5等代表；
第四列：位点2的分型结果。编码方法同上。

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一直为你喝彩

1楼 2011-09-13 16:51:55

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